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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001999`

染色体: Chr05 坐标: 20709488-20711170 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001999`
名称	SmilChr05G001999
描述	uncharacterized SmilChr05G001999
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20709488 - 20711170 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025637`
GeneID	`131025637`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025637`
原始查询	`LOC131025637`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsNRT1.1A; symbol=OsNRT1.1A; hit=Os08g0155400; species=rice; confidence=low
产物	OsNRT1.1A; symbol=OsNRT1.1A; hit=Os08g0155400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G12110` (NRT1.1) nitrate transporter 1.1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837763] identity=54.2; qcov=0.321; evalue=2.65e-14; confidence=low
Rice	`Os08g0155400` (OsNRT1.1A) - identity=50.7; qcov=0.375; evalue=3.86e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025637

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811418.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057811418.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811418.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811418.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811418.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20709543`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A7,C28,D4
`Chr5:20709543`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A7,C28,D4
`Chr5:20709634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B56,B96
`Chr5:20710994`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	38	A18,A2,A21,A22,A6,B110,B124,B13,B130,B132,B138,B30,B31,B36,B38,B39,B59,B65,B66,B72,B73,B74,B76,B77,B79,B82,B90,B92,C11,C21,C26,C31,C38,C42,C43,C45,C69,C78
`Chr5:20710996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	117	A1,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A24,A25,A3,A5,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B11,B117,B118,B120,B121,B128,B129,B131,B133,B139,B140,B15,B19,B2,B21,B23,B24,B25,B26,B29,B3,B33,B34,B35,B4,B45,B5,B51,B52,B55,B56,B57,B58,B60,B62,B63,B64,B69,B7,B70,B75,B78,B8,B80,B83,B84,B85,B87,B88,B9,B91,B93,B94,B95,B96,B97,C10,C15,C18,C22,C23,C24,C27,C29,C3,C34,C35,C37,C39,C4,C41,C47,C5,C50,C53,C56,C59,C61,C62,C63,C65,C68,C7,C70,C71,C72,C74,C77,C8,C81,C83,C84,C85,C9,D11,D3,D5,D8,D9
`Chr5:20711003`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	38	A18,A2,A21,A22,A6,B110,B124,B13,B130,B132,B138,B30,B31,B36,B38,B39,B59,B65,B66,B72,B73,B74,B76,B77,B79,B82,B90,B92,C11,C21,C26,C31,C38,C42,C43,C45,C69,C78
`Chr5:20711075`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:20711086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,B77,D1
`Chr5:20711112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:20711114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,B58
`Chr5:20711117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955435.1
ATGGAGGCCAAGGAGCTCACCGGTAGCCCATTCACGCAGATCGCCGCTGTGTTCGTGGCGGTATGGAGGAGGAGGCACCTTGAGCTGCCCTCGGACCCCTTGCTTCTGTTCAACGTCGATGAAACTCAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGCAGATGTTGCCCCACAACAAGGAGTTTCGATTATCGCCTCCTCCCTCACTCCAGCGCTGCCTCCTCGTCGCCGCCTCCCTCACTCCAGCGCTGCCTCCTCGTCGCCGCCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025637
ATGGAGGCCAAGGAGCTCACCGGTAGCCCATTCACGCAGATCGCCGCTGTGTTCGTGGCGGTATGGAGGAGGAGGCACCTTGAGCTGCCCTCGGACCCCTTGCTTCTGTTCAACGTCGATGAAACTCAGAGCAAGAAGAAGAAGAAGCAGATGTTGCCCCACAACAAGGAGTTTCGATTATCGCCTCCTCCCTCACTCCAGCGCTGCCTCCTCGTCGCCGCCTCCCTCACTCCAGCGCTGCCTCCTCGTCGCCGCCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811418.1
MEAKELTGSPFTQIAAVFVAVWRRRHLELPSDPLLLFNVDETQSKKKKKQMLPHNKEFRLSPPPSLQRCLLVAASLTPALPPRRRLPHSSDASSSPPPSLQRCLPHSSASSLTPALPPRRRLSLTPAPPPSLQRLLVAASLTPTPPSVHHHHSSCLLVAARLRPPHHKTRAHRPPSILDFGALF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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