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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002108`

染色体: Chr05 坐标: 22086110-22087144 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002108`
名称	SmilChr05G002108
描述	uncharacterized SmilChr05G002108
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22086110 - 22087144 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025655`
GeneID	`131025655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025655`
原始查询	`LOC131025655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0587600` - identity=66.7; qcov=0.096; evalue=9.18e-09; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811436.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811436.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057811436.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811436.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811436.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22086116`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr5:22086116`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr5:22086143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr5:22086154`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A4,B10,B105,B118,B137,B27,B36,B57,B61,B78,C3,C31,C53,C62,C72,C87,C9
`Chr5:22086174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B2,B33,B76,B82,B85,B93,C31,C57,C61
`Chr5:22086176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C42
`Chr5:22086188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:22086196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,D4,D6
`Chr5:22086217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:22086227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B128,B48,B52,B91
`Chr5:22086237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr5:22086251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C41

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955453.1
ATGTCTGACATCAACAAAAGAGAATTCTCCGAGCTTGCTCTTGATGGTGGTAACTATTTGACTTGGGCTTTGGATGTTGAAATATACCTCGCCTCATGTGATCTGAGCGACGCTATAGTTCCAGATTCTTCATGTAGCTCCGCCCAGAAGGCGAAAGCTTTGATTTTCTTGCGTCATCATCTGAATAAGGACTTAAAAAATGAGTACCTTACTGAAAAGGACCCTGTTGTACTATGGCAATCCCTGAAGGATCGCTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025655
ATGTCTGACATCAACAAAAGAGAATTCTCCGAGCTTGCTCTTGATGGTGGTAACTATTTGACTTGGGCTTTGGATGTTGAAATATACCTCGCCTCATGTGATCTGAGCGACGCTATAGTTCCAGATTCTTCATGTAGCTCCGCCCAGAAGGCGAAAGCTTTGATTTTCTTGCGTCATCATCTGAATAAGGACTTAAAAAATGAGTACCTTACTGAAAAGGACCCTGTTGTACTATGGCAATCCCTGAAGGATCGCTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811436.1
MSDINKREFSELALDGGNYLTWALDVEIYLASCDLSDAIVPDSSCSSAQKAKALIFLRHHLNKDLKNEYLTEKDPVVLWQSLKDRFDQQKAIILPQAQYDWLNLRFQDFKSVIEYNSTLHRIVSQLKLCKQEVTEIDLIEKTLSTFHASNLVLQQQYRAKNYTRHSELISALLVAEKHNQLLMRNHNARPVGSQAVPEAHATTYRGGRGRGRGKANWSQRGGRGWSHRGGRGRGRGRGYNHIARFRSHGKGFHKTSHPQE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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