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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002463`

染色体: Chr01 坐标: 42324140-42326493 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002463`
名称	SmilChr01G002463
描述	labd-13Z-ene-9,15,16-triol synthase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42324140 - 42326493 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025659`
GeneID	`131025659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025659`
原始查询	`LOC131025659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	labd-13Z-ene-9,15,16-triol synthase, chloroplastic-like
产物	labd-13Z-ene-9%2C15%2C16-triol synthase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G12320` (CYP706A6) cytochrome P450, family 706, subfamily A, polypeptide 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826841] identity=46.8; qcov=0.949; evalue=1.48e-165; confidence=high
Rice	`Os01g0700500` - identity=41.8; qcov=0.801; evalue=1.42e-123; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057811440.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057811440.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811440.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811440.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811440.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42324229`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr1:42324229`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr1:42324246`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A16,A6,B127,B82,B83,C70,C71
`Chr1:42324279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C56,C9
`Chr1:42324331`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A5,B50,B8,C56
`Chr1:42324331`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A5,B50,B8,C56
`Chr1:42324347`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	42	A13,A14,A19,A21,A3,A4,B108,B109,B125,B127,B128,B16,B24,B27,B30,B33,B35,B46,B47,B53,B74,B76,B88,B90,B92,C1,C11,C18,C23,C24,C25,C26,C28,C37,C43,C46,C69,C8,C82,D4,D5,D9
`Chr1:42324545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B38
`Chr1:42324545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr1:42324568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:42324720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:42324750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B126,B61,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811440.1

534 aa

267

534

p450

PF00067 p450 57-516 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811440.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	57	516	1.1e-100	338.3	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955457.1
AAATACTAAATCACATTGTTTACCTTCCTTTCCCATCGCGTTACACACTATTGCAATCAAACTACAAAAGTCAACATGCTTTTTCCCTATAAAAAAACATACTATCCTTCAATCTTACAGCAAAACAAGACGCATTTAGGGTTGGAGATGGATCCAGTTATGTTGGGATCTTGTGTCCTGTTAGCACTACTCACATCCATTTTATGGTACAAATGGAATCGCGGCGGAAAAACTCTTCCGTTACCACCAGGGCCACGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025659
ATGCTTTTTCCCTATAAAAAAACATACTATCCTTCAATCTTACAGCAAAACAAGACGCATTTAGGGTTGGAGATGGATCCAGTTATGTTGGGATCTTGTGTCCTGTTAGCACTACTCACATCCATTTTATGGTACAAATGGAATCGCGGCGGAAAAACTCTTCCGTTACCACCAGGGCCACGTGGCGTCCCCATCCTCGGCTACCTGCCTTTCATGGGCGCCGATATGCTCCAACACTTAACCCACCTTTCCCACCATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811440.1
MLFPYKKTYYPSILQQNKTHLGLEMDPVMLGSCVLLALLTSILWYKWNRGGKTLPLPPGPRGVPILGYLPFMGADMLQHLTHLSHHYGPIYKLRLGSRLAVVITSPSLLKQVVRDQDHIFAYRDATVAALTYSRGARDVVFSPPNSSWRAMRKVLVSETQSGSSLHASRELRKDQIRKAVRSIYSKIGRPVAYGELAFQTEVSLLMNLMWGGVDSDSAGELERERLGTQFRALTSSLNYLLGKPNVSDLFPLLSRFDLQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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