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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002198`

染色体: Chr05 坐标: 23445890-23446729 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002198`
名称	SmilChr05G002198
描述	uncharacterized SmilChr05G002198
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	23445890 - 23446729 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025675`
GeneID	`131025675`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025675`
原始查询	`LOC131025675`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF26130 (PB1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025675

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811454.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811454.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811454.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811454.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811454.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:23445922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C63
`Chr5:23445933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B90,C87
`Chr5:23446031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B48,C56
`Chr5:23446033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B94
`Chr5:23446033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:23446040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,A3,B66,B82
`Chr5:23446073`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	105	A14,A15,A23,A24,A5,A8,A9,B1,B10,B102,B104,B107,B11,B110,B111,B112,B115,B118,B121,B123,B124,B125,B128,B134,B135,B17,B19,B20,B22,B25,B27,B29,B30,B31,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B4,B49,B54,B58,B62,B65,B67,B68,B70,B74,B76,B78,B83,B85,B86,B89,B91,B97,B98,C1,C10,C12,C16,C17,C18,C20,C25,C26,C27,C29,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C41,C44,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C64,C66,C72,C75,C80,C81,C83,C85,C86,C87,C9,D10,D2,D7,D8
`Chr5:23446144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B63,B91
`Chr5:23446216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr5:23446223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B97,B99,C4,D6
`Chr5:23446234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B21,B70,B81,C11
`Chr5:23446241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B39,B7,B97,C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811454.1

209 aa

104

209

PB1-like

PF26130 PB1-like 10-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811454.1`	Pfam	`PF26130`	PB1-like	Domain	10	105	1.5e-08	35.5	PB1-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955471.1
AAGCCCTGATTATTCGAATTTCCCCAAATCTCTTCTCAATATTCCCGTCTAGGGTTCTTCGAAGAACACCATCAGACGCGCGCGAGCTGTTGATTTCTCCATAGCTTCGGTCGGCGATAGCTTCAAGCATGGCTGACGATGAAGTAGTGAACCCTGATACATTTGCATTATTTATACATCATGGAGGTCACTTTGAGGATTATGGGGGGTTTCCGGTTTATGCTAAGGGTTTTTACTTGGGGCTTTTCGACTTGGTACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025675
ATGGCTGACGATGAAGTAGTGAACCCTGATACATTTGCATTATTTATACATCATGGAGGTCACTTTGAGGATTATGGGGGGTTTCCGGTTTATGCTAAGGGTTTTTACTTGGGGCTTTTCGACTTGGTACCTAGTACCTTTGATTATGCCAAACTTTGTCGTGCTGTAAAGTATGTAGGATATGGGTCATGGACTAACCTGTTTTTTAGGTATCCTAGAACAAATACTTTTGTTAAGATTGTAGGGGATAGTGAAGTTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811454.1
MADDEVVNPDTFALFIHHGGHFEDYGGFPVYAKGFYLGLFDLVPSTFDYAKLCRAVKYVGYGSWTNLFFRYPRTNTFVKIVGDSEVKQMLNLLNEGISVVSVYVEGGIDSGSSRLQNNIGNIDVTHNAVFTDPRERNEQVNNDFVEGSLIQSVMIEPEIELTQVGDGELIQLENPVHNEDEGMVSDVDNLDDILDSVEQEYIEKEGVEK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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