当前解析结果
SmilChr05G002202| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002202 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002202 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002202 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 23470965 - 23471387 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025676 |
|---|---|
| GeneID | 131025676 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025676 |
| 原始查询 | LOC131025676 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025676 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057811455.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057811455.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057811455.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811455.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811455.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:23470975 |
G |
GGT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 61 | A13,A14,A16,A18,A5,B105,B11,B112,B117,B120,B123,B130,B131,B134,B136,B137,B138,B15,B18,B21,B34,B38,B4,B41,B47,B49,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B69,B7,B74,B79,B83,B84,B88,B93,B94,B96,B99,C10,C11,C15,C16,C19,C28,C30,C43,C45,C49,C50,C55,C60,C63,C66,C71,C75,D7 |
Chr5:23470977 |
T |
TGA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B91,C67 |
Chr5:23470977 |
T |
TGA |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B91,C67 |
Chr5:23470990 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,B132,C16 |
Chr5:23471029 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr5:23471045 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B38 |
Chr5:23471079 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,B80,B94,C19,C50 |
Chr5:23471117 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B124,B46,B81,C59,C84 |
Chr5:23471127 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B76,C47 |
Chr5:23471137 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A6 |
Chr5:23471182 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B114,C18,C60 |
Chr5:23471204 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 7 | B135,B42,B43,B53,C15,C45,C80 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。