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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002272`

染色体: Chr05 坐标: 24421579-24422517 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002272`
名称	SmilChr05G002272
描述	uncharacterized SmilChr05G002272
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24421579 - 24422517 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025697`
GeneID	`131025697`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025697`
原始查询	`LOC131025697`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0292200` - identity=25.8; qcov=0.298; evalue=9.21e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025697

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811471.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811471.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811471.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811471.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811471.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24421583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,A19,C15
`Chr5:24421598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr5:24421599`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C16
`Chr5:24421599`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C16
`Chr5:24421600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr5:24421626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr5:24421644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B17
`Chr5:24421683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C54,D4,D9
`Chr5:24421698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:24421722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A21,A6,B82,C78
`Chr5:24421780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C4
`Chr5:24421791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B62,B96,C39,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811471.1

312 aa

156

312

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 211-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811471.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	211	301	7.1e-06	27.4	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955488.1
ATGCAATCTTTCATGGAGATGACCAAGCAAAACATGGAGTCTCAGTCTGCTACTATCAAGCGTCTTGAAACGACTGTTGGTCAACTTTCTGGTACCTTGAACCAGATTCAGCAGCAGCAACAGCCAGGGAAACTTCATGGCCAAGGATTACAACCCCACCAAGCTCAAGCGGTCACAGTCCTTCGTAGTGGAAAGTTGGTGGATAACAAGGTGGAGGCCCCTATGGATGAGTGCCCTAAGGCGACCTGTGAGGAGGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025697
ATGCAATCTTTCATGGAGATGACCAAGCAAAACATGGAGTCTCAGTCTGCTACTATCAAGCGTCTTGAAACGACTGTTGGTCAACTTTCTGGTACCTTGAACCAGATTCAGCAGCAGCAACAGCCAGGGAAACTTCATGGCCAAGGATTACAACCCCACCAAGCTCAAGCGGTCACAGTCCTTCGTAGTGGAAAGTTGGTGGATAACAAGGTGGAGGCCCCTATGGATGAGTGCCCTAAGGCGACCTGTGAGGAGGAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811471.1
MQSFMEMTKQNMESQSATIKRLETTVGQLSGTLNQIQQQQQPGKLHGQGLQPHQAQAVTVLRSGKLVDNKVEAPMDECPKATCEEESEKDLPPLREEEKKGEPEVKLHKATQPYRPPIPYPSRLMNEKQDQQFTDFYNMLAKVNVNLPLLEVIKNVPAYVKFFKELASNKRRFMDNEKILVSEVANSIMQQPLPPKQRDQGSFVFNIALGNGKEASGMLDLGARINLMPYSIFKQLDLGDIKPTRMCLQLADRSVRYPCG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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