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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002303`

染色体: Chr05 坐标: 24895899-24897462 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002303`
名称	SmilChr05G002303
描述	mannose-1-phosphate guanylyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24895899 - 24897462 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025700`
GeneID	`131025700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025700`
原始查询	`LOC131025700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mannose-1-phosphate guanylyltransferase 1-like
产物	mannose-1-phosphate guanylyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT2G39770` (CYT1) Glucose-1-phosphate adenylyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818562] identity=73.9; qcov=0.879; evalue=1.6e-62; confidence=high
Rice	`Os03g0268400` (OsMPG3) - identity=80.9; qcov=0.701; evalue=9.46e-58; confidence=high
GO	GO:0000032 (cell wall mannoprotein biosynthetic process); GO:0004475 (mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GTP) activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006486 (GO:0006486); GO:0009298 (GDP-mannose biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF00483 (NTP_transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811473.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811473.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811473.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811473.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811473.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24896116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B26,B64,B8,C58
`Chr5:24896151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B93,B97,C46,C60
`Chr5:24896153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B26,C58
`Chr5:24896164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B26,C58
`Chr5:24896186`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	111	A1,A13,A18,A2,A23,A24,A4,A8,A9,B1,B102,B104,B106,B11,B115,B118,B120,B121,B123,B126,B129,B131,B133,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B19,B20,B21,B26,B27,B3,B32,B33,B37,B39,B41,B42,B45,B47,B48,B50,B52,B59,B62,B63,B64,B67,B70,B72,B74,B75,B76,B8,B80,B81,B88,B89,B90,B92,B94,B98,B99,C16,C17,C18,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C29,C32,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C45,C48,C5,C53,C56,C57,C58,C59,C61,C64,C66,C68,C72,C76,C80,C81,C84,C85,C86,C87,D11,D2,D3,D7
`Chr5:24897339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr5:24897419`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A20,B110,B131,B66,B67,B84,B85,C10,C4,C44,C73
`Chr5:24897447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B131,B4,B66,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811473.1

157 aa

157

NTP_transferase

PF00483 NTP_transferase 47-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811473.1`	Pfam	`PF00483`	NTP_transferase	Family	47	153	1.5e-21	77.8	Nucleotidyl transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955490.1
ATGAGAGGGGCTCCGCCAATCTGTAGGCGTAAGGGTCAGGCGAGGGAGGAGAGGCAGGGAGAGCTGTTGAGGGCGGTAGCCGTAGCAGGAGTTGTGGTCACCGGAGTGTCGAGGGACGGAGGTGACGTCGGTTGGGTAATGCTAAACTTTTTGAAAGATTTTGAGGCAAAGCTTGAGATTAAGATCACATGTTCGCAAGAGACTGAACCTCTTGGAACAGTCGGTCCCCTTGCTTGGGCTAGGGACAAGCTGATAGATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025700
ATGAGAGGGGCTCCGCCAATCTGTAGGCGTAAGGGTCAGGCGAGGGAGGAGAGGCAGGGAGAGCTGTTGAGGGCGGTAGCCGTAGCAGGAGTTGTGGTCACCGGAGTGTCGAGGGACGGAGGTGACGTCGGTTGGGTAATGCTAAACTTTTTGAAAGATTTTGAGGCAAAGCTTGAGATTAAGATCACATGTTCGCAAGAGACTGAACCTCTTGGAACAGTCGGTCCCCTTGCTTGGGCTAGGGACAAGCTGATAGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811473.1
MRGAPPICRRKGQAREERQGELLRAVAVAGVVVTGVSRDGGDVGWVMLNFLKDFEAKLEIKITCSQETEPLGTVGPLAWARDKLIDKSGKPFSVLNSDVISEYPLKEMIVFHKSHGGEASIMVTKVDEPSNYGVVVIEESTGKVERFVERPKLFMRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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