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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002319`

染色体: Chr05 坐标: 24998463-25000169 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002319`
名称	SmilChr05G002319
描述	DELLA protein RGL1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24998463 - 25000169 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025705`
GeneID	`131025705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025705`
原始查询	`LOC131025705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DELLA protein RGL1-like
产物	DELLA protein RGL1-like
Arabidopsis	`AT3G03450` (RGL2) RGA-like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821251] identity=28.9; qcov=0.671; evalue=3.57e-47; confidence=low
Rice	`Os03g0707600` (SLR1) - identity=26.1; qcov=0.701; evalue=9.93e-42; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811480.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811480.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811480.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811480.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24998490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr5:24998805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B33,B68
`Chr5:24999014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B33,B68,C48
`Chr5:24999032`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	72	A11,A23,A24,A4,A7,B103,B104,B11,B113,B114,B117,B121,B126,B139,B15,B22,B26,B3,B4,B41,B50,B52,B54,B56,B58,B69,B7,B72,B73,B75,B78,B84,B85,B86,B89,B9,B90,B92,B95,B96,B98,C1,C28,C29,C3,C30,C33,C34,C35,C40,C41,C42,C46,C51,C53,C55,C56,C57,C6,C60,C61,C62,C64,C7,C77,C79,C83,C84,D1,D4,D6,D9
`Chr5:24999035`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B13,B137,B42,B43,B87
`Chr5:24999035`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B13,B137,B42,B43,B87
`Chr5:24999099`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B42,B43,B87,D1
`Chr5:24999101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A11,B10,B126,B15,B22,B50,B82,B89,B9,B95,B98,C1,C33,C34,C35,C40,C46,C55,C6,C60,C62,C79,C83,D4
`Chr5:24999169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B104,B26
`Chr5:24999172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B137,B42,B43,B87
`Chr5:24999196`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A11,A18,A9,B10,B126,B15,B22,B40,B50,B89,B9,B95,B98,C1,C33,C34,C35,C40,C44,C46,C55,C6,C60,C62,C79,C83,D4,D8
`Chr5:24999335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	94	A1,A11,A18,A23,A24,A25,A4,A6,A7,A9,B10,B103,B104,B11,B113,B114,B117,B121,B124,B126,B130,B137,B139,B15,B17,B22,B26,B31,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B50,B52,B54,B56,B58,B69,B7,B72,B73,B75,B78,B82,B84,B85,B86,B89,B9,B90,B92,B95,B98,C1,C21,C28,C29,C3,C30,C33,C34,C35,C40,C41,C42,C44,C46,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C6,C60,C61,C62,C64,C66,C7,C75,C77,C79,C82,C83,C84,D1,D4,D6,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811480.1

568 aa

284

568

GRAS

PF03514 GRAS 186-557 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811480.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	186	557	5.5e-76	256.6	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955497.1
ATGTTGAGTAGTATTTTCCAAAACGAGAGATTCTATAGCTATGGGACTGTAGATGATCACAGCTTGGAGAATTTAGTGAAGCAATATGGAGATGAAGAGGCGGTAGAGGTAGCTATGGATATGGATATCGATTCTTATGGCCGCGGGAAGAGTTCTTCTGCTGATGATACTGCTCATGCAGACTATGTTGCATATGGGAGCGAGGTCGAATATACGAGTTTAGATAACTTGTATCATGATAATACACCACAATTTTGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025705
ATGTTGAGTAGTATTTTCCAAAACGAGAGATTCTATAGCTATGGGACTGTAGATGATCACAGCTTGGAGAATTTAGTGAAGCAATATGGAGATGAAGAGGCGGTAGAGGTAGCTATGGATATGGATATCGATTCTTATGGCCGCGGGAAGAGTTCTTCTGCTGATGATACTGCTCATGCAGACTATGTTGCATATGGGAGCGAGGTCGAATATACGAGTTTAGATAACTTGTATCATGATAATACACCACAATTTTGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811480.1
MLSSIFQNERFYSYGTVDDHSLENLVKQYGDEEAVEVAMDMDIDSYGRGKSSSADDTAHADYVAYGSEVEYTSLDNLYHDNTPQFCSCGDELKRVVSVKSPQKPFQILKKYASRCRRLNGENMTFASYERESQMIFSPSVETLIQLGAEKFIKSSSKVSDELSVLCHPYPSSILCHSGEDCEGVRLVETLLSCAEKVDKKQYEEACELLLECDRMSSATGSVIQRLVFYFAEGLYEKIDRETGQITPKGLGKKVEDPLIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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