当前解析结果
SmilChr05G002343| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002343 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002343 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002343 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 25398713 - 25399320 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025709 |
|---|---|
| GeneID | 131025709 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025709 |
| 原始查询 | LOC131025709 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0484800- identity=33.9; qcov=0.785; evalue=7.3e-17; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025709 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811484.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057811484.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057811484.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811484.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811484.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:25398741 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A23,B131,B52,C29 |
Chr5:25398742 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 24 | A13,A8,B11,B118,B120,B126,B14,B19,B27,B3,B47,B62,B67,B70,B71,B8,C2,C40,C41,C45,C56,C65,C81,C85 |
Chr5:25398753 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B27,B99,C87 |
Chr5:25398787 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr5:25398790 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B106,B139 |
Chr5:25398795 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C53 |
Chr5:25398811 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A23,B131,B140,B52,C29 |
Chr5:25398811 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B131,B140,B52,C29 |
Chr5:25398864 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C35 |
Chr5:25398864 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr5:25398879 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B131,B140,B52,C29 |
Chr5:25398880 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 82 | A21,A4,A7,A9,B106,B110,B111,B112,B119,B123,B129,B133,B134,B138,B140,B16,B2,B20,B22,B30,B31,B33,B36,B38,B39,B4,B41,B47,B48,B50,B55,B56,B57,B59,B62,B63,B66,B71,B78,B81,B82,B87,B88,B90,B92,B96,B98,C1,C13,C14,C17,C19,C21,C22,C23,C24,C27,C32,C34,C35,C41,C45,C46,C5,C53,C54,C6,C61,C64,C66,C68,C70,C74,C8,C80,C83,C84,C86,C9,D11,D3,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。