当前解析结果
SmilChr05G002366| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002366 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002366 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002366 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 25834379 - 25835014 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025714 |
|---|---|
| GeneID | 131025714 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025714 |
| 原始查询 | LOC131025714 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0191000- identity=31; qcov=0.336; evalue=2.03e-06; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025714 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057811489.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057811489.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811489.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811489.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811489.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:25834396 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,B139,D10 |
Chr5:25834489 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B101 |
Chr5:25834493 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 17 | A21,A9,B106,B119,B123,B134,B2,B30,B41,B87,B95,C10,C35,C36,C63,C73,D6 |
Chr5:25834494 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,B139,D10 |
Chr5:25834594 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B131 |
Chr5:25834613 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B69,C19,C32,C68 |
Chr5:25834634 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,B74 |
Chr5:25834643 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,B74 |
Chr5:25834676 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B74,C60,D2 |
Chr5:25834698 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C18,C29,C72,D2 |
Chr5:25834703 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B69,C19,C32,C68 |
Chr5:25834713 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B136,B30,B41,C36,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。