当前解析结果
SmilChr05G002367| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002367 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002367 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002367 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 25837202 - 25838719 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025715 |
|---|---|
| GeneID | 131025715 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025715 |
| 原始查询 | LOC131025715 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025715 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811490.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057811490.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057811490.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811490.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811490.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:25837210 |
G |
GTA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 3 | A3,B35,C4 |
Chr5:25837210 |
G |
GTA |
2bp_insertion | CDS_variant | 3 | A3,B35,C4 |
Chr5:25837220 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B140,B69,C19,C32,C68 |
Chr5:25837221 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,B35,C4 |
Chr5:25837229 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,B139,D10 |
Chr5:25837235 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C64,C66 |
Chr5:25837276 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A3,B103,B115,B125,B22,B31,B36,B45,B79,C12,D11 |
Chr5:25837330 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | B120,B122,B138,B49,B77,B94,C20,C29,C33,C65 |
Chr5:25837343 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B106,B139,C64,C66,D10 |
Chr5:25837353 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 10 | B120,B122,B49,B77,B94,C20,C29,C33,C37,C65 |
Chr5:25837357 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B69,C19,C32,C68 |
Chr5:25837359 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。