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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002383`

染色体: Chr05 坐标: 26256393-26257364 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002383`
名称	SmilChr05G002383
描述	uncharacterized SmilChr05G002383
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26256393 - 26257364 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025719`
GeneID	`131025719`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025719`
原始查询	`LOC131025719`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=34.6; qcov=0.582; evalue=1.35e-25; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025719

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811494.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811494.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057811494.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811494.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811494.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26256398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B20,B48,B94,D3
`Chr5:26256406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B43,B78,C86
`Chr5:26256412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B43,B78
`Chr5:26256428`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A14,B132,B16,C56,C81,D6
`Chr5:26256449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C77
`Chr5:26256496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C38
`Chr5:26256501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:26256515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B64,C20,C87
`Chr5:26256519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,D5
`Chr5:26256558`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B140
`Chr5:26256558`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B140
`Chr5:26256565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811494.1

323 aa

162

323

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 46-211 aa PF03732 PEG10_N-capsid 51-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811494.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	46	211	1.6e-11	44.7	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057811494.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	51	130	3.7e-15	56.7	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955511.1
ATGCCGCCCCGTAGAGCCCCTACCGATCAACAAAACGGGATGCAAGAATTTATCGCCGCAATGCAAGGATTCTTTCAACAACAAGCTCAAGGTGCGCAAAACCCACAACGCAATAACACAAGCGTAGTCGTAGAGCAGTTCCGACGTTATAATCCACCAAGATTTGACGGGAGGAGTGGACCTCTAGCAATGGAGGAATGGATAAGAGAGCTGGAGAGAATCTTTGAACATATCGAGTGCACCGATGCCCACAAAGTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025719
ATGCCGCCCCGTAGAGCCCCTACCGATCAACAAAACGGGATGCAAGAATTTATCGCCGCAATGCAAGGATTCTTTCAACAACAAGCTCAAGGTGCGCAAAACCCACAACGCAATAACACAAGCGTAGTCGTAGAGCAGTTCCGACGTTATAATCCACCAAGATTTGACGGGAGGAGTGGACCTCTAGCAATGGAGGAATGGATAAGAGAGCTGGAGAGAATCTTTGAACATATCGAGTGCACCGATGCCCACAAAGTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811494.1
MPPRRAPTDQQNGMQEFIAAMQGFFQQQAQGAQNPQRNNTSVVVEQFRRYNPPRFDGRSGPLAMEEWIRELERIFEHIECTDAHKVSCAVFQFCEDASHWWESFKRSMTEQARQGLTWNRFKEIVTNQYFPRSYRNQKEVEFLDLKQGELSITDYERKFNQLSRYATRLVNTNDQKADRFLRGLRPEIRGILAAQGIEDYALAVRRAQEVEAGLEMDKLPRKNMVRNEKRKWEDSNDGEKDMQNKKERVENKSNEAPQRT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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