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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002480`

染色体: Chr01 坐标: 42534282-42535332 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002480`
名称	SmilChr01G002480
描述	germin-like protein subfamily 1 member 20
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42534282 - 42535332 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025739`
GeneID	`131025739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025739`
原始查询	`LOC131025739`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	germin-like protein subfamily 1 member 20
产物	germin-like protein subfamily 1 member 20
Arabidopsis	`AT5G39190` (GER2) germin-like protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833914] identity=59.4; qcov=0.974; evalue=1.17e-91; confidence=high
Rice	`Os02g0491600` (OsGLP2-1) - identity=62.8; qcov=0.9; evalue=8.28e-88; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057811510.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811510.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811510.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811510.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811510.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42534511`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	B109,B110,B131,B35,B55,B58,B77,B93,C52,C62,C81,D5
`Chr1:42534515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr1:42534583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:42534619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr1:42534626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C36,D4
`Chr1:42534634`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	C14,C35,C36,D4
`Chr1:42534634`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	C14,C35,C36,D4
`Chr1:42534636`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	C14,C35,C36,D4
`Chr1:42534636`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	C14,C35,C36,D4
`Chr1:42534640`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	C14,C35,C36,D4
`Chr1:42534640`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	4	C14,C35,C36,D4
`Chr1:42534722`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A3,B117,B48,B69,B76,B84,C31,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811510.1

230 aa

115

230

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 64-216 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811510.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	64	216	1.4e-50	171.5	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955527.1
CACACACATATATATATATTATTATTAAATGAAGATGAGTTTTGGTTTGGGCACCATTGTTGTTATGTTGTGGTGGGCTTCGATTGCATATGCAGCTGATCCAAATCCTCTTCAAGATTTTTGCGTTGCTCTTCATGATAACATCTCTGATGTTTTTGTAAATGGGAAATTTTGCAAGAACCCGAACAAGGTGGTTGCAAAGGATTTTCTTTTCGAGGGTCTAAACATCCCCGGAAATACATCCAATCAGTTCGGATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025739
ATGAAGATGAGTTTTGGTTTGGGCACCATTGTTGTTATGTTGTGGTGGGCTTCGATTGCATATGCAGCTGATCCAAATCCTCTTCAAGATTTTTGCGTTGCTCTTCATGATAACATCTCTGATGTTTTTGTAAATGGGAAATTTTGCAAGAACCCGAACAAGGTGGTTGCAAAGGATTTTCTTTTCGAGGGTCTAAACATCCCCGGAAATACATCCAATCAGTTCGGATTCATCGTGACTCCAGTGAACGTGAACCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811510.1
MKMSFGLGTIVVMLWWASIAYAADPNPLQDFCVALHDNISDVFVNGKFCKNPNKVVAKDFLFEGLNIPGNTSNQFGFIVTPVNVNQLPGLNTLGVSLARLDFAKYGINPPHTHPRATEALFLLKGTLYVGFVTSNPADPNQRNKLFAQYLKPGDVYVFPQGLIHFQFNVGKTEAVAFAGFGSQNPGTITIANAVFGSDPKIDPIVLAKAFQVEKKIIKYLQAQFWPNLTY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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