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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002592`

染色体: Chr05 坐标: 29111035-29112357 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002592`
名称	SmilChr05G002592
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29111035 - 29112357 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025767`
GeneID	`131025767`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025767`
原始查询	`LOC131025767`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=32.7; qcov=0.895; evalue=1.16e-59; confidence=low
Rice	`Os03g0822100` - identity=35.3; qcov=0.868; evalue=2.81e-80; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF27039 (ZBED1_RNase-like_helical); PF27041 (ZBED1_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025767

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811535.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811535.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811535.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811535.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29111047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr5:29111065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,C28,C51
`Chr5:29111084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:29111101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A25,C74,C80
`Chr5:29111146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C4,C76
`Chr5:29111213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A14,A3,B108,B115,B12,B20,B21,B25,B52,B9,C1,C15,C18,C19,C28,C31,C37,C44,C55,C63,C73,D1
`Chr5:29111232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr5:29111274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,B107,C48,D6
`Chr5:29111283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D4
`Chr5:29111503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A25,B102,B107,B108,B111,B117,B120,B121,B130,B134,B15,B25,B39,B6,B7,B77,B78,B90,B97,C2,C28,C31,C41,C49,C54,C65,C69,C73,C81
`Chr5:29111545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr5:29111554`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A20,A9,B104,B64,B65,C19,C42,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811535.1

440 aa

220

440

ZBED1_RNase-like

ZBED1_RNase-like_helical

PF27041 ZBED1_RNase-like 211-306 aa PF27039 ZBED1_RNase-like_helical 310-419 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811535.1`	Pfam	`PF27041`	ZBED1_RNase-like	Domain	211	306	1.5e-32	112.3	ZBED1 RNase-like domain
`XP_057811535.1`	Pfam	`PF27039`	ZBED1_RNase-like_helical	Domain	310	419	2.1e-37	128.3	ZBED1 RNase-like helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955552.1
ATGTCGCTTCAAGAATCAACCCTAATTCCAGCGCCACTTCAGAATCACAGTGATGGACAAGCAGCTGGTATCCATGTAAATCAACTAGATCCGAACCATGAGGTTGAGACAGAGATTAGAGAAAAGAATCAAGACAATCCCTACATGACAAAGAAAAGAAAACGCACATCCAAAGTGTGGGATGACTTCAAAGAGATCACTGATGTAAAAGGAAATGTGAAAGCCGAATGCATTCACTGCAAGACACGGCTATCAGTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025767
ATGTCGCTTCAAGAATCAACCCTAATTCCAGCGCCACTTCAGAATCACAGTGATGGACAAGCAGCTGGTATCCATGTAAATCAACTAGATCCGAACCATGAGGTTGAGACAGAGATTAGAGAAAAGAATCAAGACAATCCCTACATGACAAAGAAAAGAAAACGCACATCCAAAGTGTGGGATGACTTCAAAGAGATCACTGATGTAAAAGGAAATGTGAAAGCCGAATGCATTCACTGCAAGACACGGCTATCAGTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811535.1
MSLQESTLIPAPLQNHSDGQAAGIHVNQLDPNHEVETEIREKNQDNPYMTKKRKRTSKVWDDFKEITDVKGNVKAECIHCKTRLSVNKTGCTTHLARHSAKCTAKQIHSTKGQQIISITMSMAQKEAVSSVTNFKYDHSKIREVLSHMIIVHELPFRFPEYELFNLLMKSATPLYNKISRATAKKDCWASYELEKKRLMNELKGVSRVSVTTDLWTSDQNISYMVVTGHYVDSNWNLQKRTLNFCDIPPPHTGVVISDVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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