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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002620`

染色体: Chr05 坐标: 29513997-29514527 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002620`
名称	SmilChr05G002620
描述	uncharacterized SmilChr05G002620
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29513997 - 29514527 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025774`
GeneID	`131025774`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025774`
原始查询	`LOC131025774`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0629600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0629600` - identity=22; qcov=1.06; evalue=6.22e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025774

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811542.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811542.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811542.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811542.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811542.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29514010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr5:29514102`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B101,D3
`Chr5:29514102`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B101,D3
`Chr5:29514123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:29514128`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr5:29514128`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr5:29514129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:29514132`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	51	A15,A20,A22,B10,B107,B117,B120,B125,B127,B131,B2,B20,B23,B26,B28,B35,B39,B42,B43,B46,B49,B54,B55,B59,B70,B77,B80,B83,B90,B91,B97,B98,C13,C15,C17,C24,C26,C27,C28,C38,C40,C48,C50,C51,C54,C60,C65,C7,C87,D10,D5
`Chr5:29514143`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr5:29514143`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr5:29514151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B77,C35,D10
`Chr5:29514154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811542.1

176 aa

176

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 51-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811542.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	51	173	1.5e-10	41.8	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955559.1
ATGTCTATGTCTCCTATCATCTCTTTACTTGCTAATATTCCTCTCACCGGACCAAATTTTGCTGAATGGAAACGCTATCTTACTTATATTCTTGTCGCTGAGGAGCACAATTTCGTGCTCACCACTCCTCGTCCCCTCGCTCTTACTGATGAGTCGACTGATGCAGAAAAGGAAGAGCATAAAAGGTGGCATAAGTCAAATAATATGGCGAAATACTATATGATGATGACTACAATGTCACAAACCTTGCAACTTCAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025774
ATGTCTATGTCTCCTATCATCTCTTTACTTGCTAATATTCCTCTCACCGGACCAAATTTTGCTGAATGGAAACGCTATCTTACTTATATTCTTGTCGCTGAGGAGCACAATTTCGTGCTCACCACTCCTCGTCCCCTCGCTCTTACTGATGAGTCGACTGATGCAGAAAAGGAAGAGCATAAAAGGTGGCATAAGTCAAATAATATGGCGAAATACTATATGATGATGACTACAATGTCACAAACCTTGCAACTTCAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811542.1
MSMSPIISLLANIPLTGPNFAEWKRYLTYILVAEEHNFVLTTPRPLALTDESTDAEKEEHKRWHKSNNMAKYYMMMTTMSQTLQLQHQVMDDAATIMLNLIEVFGKSERSARFNIMREILACEMSESSSVHKHVMHMINLFDRLDLLGGGIDGEAKVDIILNTLSKTYETSASMLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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