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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002634`

染色体: Chr05 坐标: 29724668-29725425 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002634`
名称	SmilChr05G002634
描述	acyl transferase 4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	29724668 - 29725425 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025778`
GeneID	`131025778`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025778`
原始查询	`LOC131025778`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acyl transferase 4-like
产物	acyl transferase 4-like
Arabidopsis	`AT3G62160` (AT3G62160) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825389] identity=54.1; qcov=1.02; evalue=2.32e-91; confidence=high
Rice	`Os05g0278500` (OsAT5) - identity=43.1; qcov=1.01; evalue=1.48e-61; confidence=medium
GO	GO:0016410 (GO:0016410)
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025778

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811546.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811546.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811546.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811546.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811546.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:29724679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,B8
`Chr5:29724682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B131,B97
`Chr5:29724688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:29724690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,D10,D5
`Chr5:29724704`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	87	A1,A19,A21,A22,A23,A24,A3,B101,B105,B106,B109,B117,B119,B126,B128,B13,B135,B136,B138,B15,B17,B21,B23,B25,B26,B27,B33,B34,B4,B45,B52,B53,B55,B57,B67,B7,B79,B8,B82,B86,B91,B94,B97,C11,C14,C16,C17,C2,C21,C22,C25,C27,C28,C29,C3,C31,C35,C37,C38,C40,C45,C47,C48,C50,C53,C58,C63,C65,C69,C71,C73,C74,C76,C78,C79,C81,C83,C86,C87,D1,D10,D2,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr5:29724705`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	81	A19,A21,A22,A23,A24,A3,B101,B105,B106,B109,B117,B119,B126,B128,B13,B135,B136,B138,B15,B17,B21,B23,B25,B26,B27,B33,B34,B4,B45,B52,B53,B55,B57,B67,B7,B79,B8,B82,B86,B91,B94,B97,C11,C14,C16,C17,C2,C21,C22,C25,C27,C28,C3,C31,C35,C37,C38,C45,C47,C48,C50,C53,C58,C65,C69,C71,C73,C74,C76,C78,C79,C81,C83,C86,C87,D1,D10,D5,D7,D8,D9
`Chr5:29724711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C1,D4
`Chr5:29724719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C58
`Chr5:29724720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,D10
`Chr5:29724725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr5:29724734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B105,B33,C53
`Chr5:29724738`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A3,B107,B110,B127,B134,B68,B83,C10,C26,C54,C6,C63,C64,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811546.1

252 aa

126

252

Transferase

PF02458 Transferase 19-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811546.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	19	251	7.4e-35	121.2	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955563.1
CGGGCCCCTATCCCCTATGACAGCCTACTGCCTCCTCCGTCGCCACAAACTGCCGGCGTAGATCCTCTAGTGCAAATGCAGGTAACACAATTTGGTTGCGGGGGATTCGTGATGGGGCTGATATTTTGCCACGGCATATGCGACGGGCTCGGCGCGGCGCAGTTCTTCAACGCGGTCGGAGAAATGGCTAGAGGGGCTAAGGCACCGAGTACCGCGCCGGAGTGGTGCCGAAATTTCCTCCCACGATCGCCGCCATCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025778
CGGGCCCCTATCCCCTATGACAGCCTACTGCCTCCTCCGTCGCCACAAACTGCCGGCGTAGATCCTCTAGTGCAAATGCAGGTAACACAATTTGGTTGCGGGGGATTCGTGATGGGGCTGATATTTTGCCACGGCATATGCGACGGGCTCGGCGCGGCGCAGTTCTTCAACGCGGTCGGAGAAATGGCTAGAGGGGCTAAGGCACCGAGTACCGCGCCGGAGTGGTGCCGAAATTTCCTCCCACGATCGCCGCCATCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811546.1
RAPIPYDSLLPPPSPQTAGVDPLVQMQVTQFGCGGFVMGLIFCHGICDGLGAAQFFNAVGEMARGAKAPSTAPEWCRNFLPRSPPSAPLSLAILVSDYQLEPAIIDVSMDEIKKLKQEFQQRSGKRCSTIEMVATMLWRQRTEAIRLDEETEVKLVFFANCRHVVEPPLPEGFYGNCFFPVSMSARSGKVVAKNVYEVVEVIKGKARLAEEFGKWVRGXMRDPFAPPLEYRTLFISEWGLGFMEVDYGWGKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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