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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002658`

染色体: Chr05 坐标: 30073031-30074411 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002658`
名称	SmilChr05G002658
描述	brassinosteroid LRR receptor kinase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	30073031 - 30074411 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025783`
GeneID	`131025783`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025783`
原始查询	`LOC131025783`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	brassinosteroid LRR receptor kinase-like
产物	brassinosteroid LRR receptor kinase-like
Arabidopsis	`AT4G39400` (BRI1) Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830095] identity=34.9; qcov=0.86; evalue=6.59e-17; confidence=low
Rice	`Os02g0635600` - identity=29.5; qcov=0.86; evalue=4.15e-09; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025783

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057811552.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057811552.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811552.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811552.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811552.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:30073888`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	133	A10,A14,A15,A16,A19,A2,A21,A23,A24,A25,A4,A5,A7,A9,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B120,B122,B123,B125,B127,B13,B130,B131,B132,B133,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B18,B2,B20,B21,B23,B24,B27,B31,B34,B35,B36,B40,B41,B48,B52,B53,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B66,B68,B70,B71,B73,B75,B8,B81,B82,B84,B85,B86,B88,B91,B94,B95,B98,B99,C1,C10,C13,C14,C17,C18,C19,C22,C24,C25,C27,C28,C29,C3,C34,C37,C39,C40,C41,C43,C44,C47,C48,C49,C51,C53,C56,C57,C58,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C70,C71,C77,C80,C82,C86,C9,D1,D11,D2,D3,D5
`Chr5:30073891`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	89	A10,A14,A16,A2,A23,A25,A4,A7,B101,B105,B106,B107,B11,B110,B111,B112,B113,B120,B125,B127,B13,B130,B131,B132,B133,B137,B139,B16,B18,B2,B20,B23,B27,B31,B34,B40,B48,B53,B58,B6,B60,B62,B63,B68,B70,B71,B75,B82,B84,B85,B86,B88,B91,B98,C1,C13,C14,C17,C22,C25,C27,C28,C34,C39,C40,C43,C47,C48,C49,C51,C53,C56,C57,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C77,C80,C82,C86,C9,D11,D3,D5
`Chr5:30073953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:30074044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr5:30074109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C47,C6
`Chr5:30074125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B74,C4,C42,C85
`Chr5:30074147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B104,B119,C3
`Chr5:30074173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B104,B119
`Chr5:30074181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr5:30074230`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B9
`Chr5:30074230`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B9
`Chr5:30074247`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A1,A21,B100,B122,B29,B32,B5,B72,B76,B9,B90,B97,C11,C14,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811552.1

193 aa

193

LRRNT_2

LRR_1

LRR_6

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 45-80 aa PF00560 LRR_1 130-146 aa PF13516 LRR_6 169-184 aa PF00560 LRR_1 170-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811552.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	45	80	5.1e-08	33.8	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057811552.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	130	146	2.3e-05	24.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057811552.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	169	184	3.8e-06	27.2	Leucine Rich repeat
`XP_057811552.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	170	183	2.3e-05	24.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955569.1
ATGAAGATTGCGATTGTGGTGTTAAAGCTGACAACAATCTCTTCCACCACCGCAGCCGACGACAAGCTCTCCTCCTCCTCCTCTCTCCTAGCCTTCCTATCCTCAACCGCAGAGAAAAACAACCTCGTGCGCGACTCCCAGCATCTCATCTCCTTCAAAAACTCCCTCTCCGACCCCTACCAGCTCCCATCATGGCAACCCACCATATACCCCTGCAACTTCCATGATGTCTCCTGCAACTCCTCCCGCGTCTCCTCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025783
ATGAAGATTGCGATTGTGGTGTTAAAGCTGACAACAATCTCTTCCACCACCGCAGCCGACGACAAGCTCTCCTCCTCCTCCTCTCTCCTAGCCTTCCTATCCTCAACCGCAGAGAAAAACAACCTCGTGCGCGACTCCCAGCATCTCATCTCCTTCAAAAACTCCCTCTCCGACCCCTACCAGCTCCCATCATGGCAACCCACCATATACCCCTGCAACTTCCATGATGTCTCCTGCAACTCCTCCCGCGTCTCCTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811552.1
MKIAIVVLKLTTISSTTAADDKLSSSSSLLAFLSSTAEKNNLVRDSQHLISFKNSLSDPYQLPSWQPTIYPCNFHDVSCNSSRVSSIELSNFHLDTDFSTVATFLLSLQTLKTPTSPAQSPPPLDFPAALTSLDLSQNSLSGPISDLPALAANSIDLLPHSPPPAAAIPSLKTLDLSHNNISDDTSAIWLLSI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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