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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002729`

染色体: Chr05 坐标: 31403490-31403951 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002729`
名称	SmilChr05G002729
描述	zinc finger protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31403490 - 31403951 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025801`
GeneID	`131025801`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025801`
原始查询	`LOC131025801`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein 3-like
产物	zinc finger protein 3-like
Arabidopsis	`AT1G68360` (AT1G68360) C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843165] identity=87.2; qcov=0.307; evalue=1.33e-23; confidence=low
Rice	`Os01g0512700` - identity=78.7; qcov=0.307; evalue=1.62e-20; confidence=low
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway); GO:0009740 (gibberellic acid mediated signaling pathway); GO:0010026 (trichome differentiation); GO:0010090 (trichome morphogenesis)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025801

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811573.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811573.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811573.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811573.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811573.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31403565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B97,C78
`Chr5:31403567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B23,B31,C28
`Chr5:31403572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr5:31403585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B35,C23
`Chr5:31403646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr5:31403659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B75
`Chr5:31403694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C14,C25
`Chr5:31403703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr5:31403726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B12,B139,B78,C53
`Chr5:31403736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B137,C2
`Chr5:31403742`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B128,B49,C43,C44,C49,C55
`Chr5:31403749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955590.1
ATGAATGACAAAGTGTATCCATCAGCGAAGCCCACTGCCAATGGCGGCGGCGGCGCTCCCACCGCGGCGAACCCGGTGTTCCCGGCGAACAAAGCGCAGTTCTACAACTCCACGCGGCCGACCACCGCCGCGGCTGCTGCTGCTCGTGCTGCCTCTGGTCGACTCTGGCGATCCTCCTCCACCTTGAAAGATTCCGAGTTCCCCGCCTCCGACGGCCGGAAATACGAGTGTCAATACTGCTGCCGCGAGTTCGCCAACTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025801
ATGAATGACAAAGTGTATCCATCAGCGAAGCCCACTGCCAATGGCGGCGGCGGCGCTCCCACCGCGGCGAACCCGGTGTTCCCGGCGAACAAAGCGCAGTTCTACAACTCCACGCGGCCGACCACCGCCGCGGCTGCTGCTGCTCGTGCTGCCTCTGGTCGACTCTGGCGATCCTCCTCCACCTTGAAAGATTCCGAGTTCCCCGCCTCCGACGGCCGGAAATACGAGTGTCAATACTGCTGCCGCGAGTTCGCCAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811573.1
MNDKVYPSAKPTANGGGGAPTAANPVFPANKAQFYNSTRPTTAAAAAARAASGRLWRSSSTLKDSEFPASDGRKYECQYCCREFANSQALGDHQNAHKKERQQLKRAQLQASRDAAASYMRPMVSPLTADSLHAIHNLKARQQYKRNYKGVLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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