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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002740`

染色体: Chr05 坐标: 31571935-31573080 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002740`
名称	SmilChr05G002740
描述	putative F-box protein At2g02030
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31571935 - 31573080 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025803`
GeneID	`131025803`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025803`
原始查询	`LOC131025803`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At2g02030
产物	putative F-box protein At2g02030
Arabidopsis	`AT1G33530` (AT1G33530) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840247] identity=26.9; qcov=0.643; evalue=2.64e-18; confidence=low
Rice	`Os04g0194000` (OsFbox184) - identity=26.3; qcov=0.638; evalue=7.47e-09; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025803

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811576.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811576.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811576.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811576.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31571986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A24,B46,B50,D3
`Chr5:31572006`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr5:31572115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B128
`Chr5:31572131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B128,C4
`Chr5:31572146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B128,C4
`Chr5:31572150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B128,C4
`Chr5:31572166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B128,C4
`Chr5:31572170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B128,C4
`Chr5:31572177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B128,C4
`Chr5:31572234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B128,C4
`Chr5:31572264`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A3
`Chr5:31572264`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811576.1

381 aa

190

381

F-box

PF00646 F-box 13-51 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811576.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	13	51	1.3e-08	35.1	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955593.1
ATGGATAACAAAAGCAGCAAAGTATCTCTCCTTTTTCTTCATGAAGCAATCATCGAAGAAATACTGTTAAGAATTCCGGTGAGATCTCTCTTGAGATTCCGTTGCGTTTCGAAATCATGGCGTTGTTTGATTGACAGCGACCGATTCATCAAAAACCACTTCCAAACCTCATCAAAAAACGCATCTTTGGCCCATCACAGGCATTTTTATTTTCTTGACTCGCACGTGGAGGCCGTCTCGGACAAGAAGGCCGTCTCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025803
ATGGATAACAAAAGCAGCAAAGTATCTCTCCTTTTTCTTCATGAAGCAATCATCGAAGAAATACTGTTAAGAATTCCGGTGAGATCTCTCTTGAGATTCCGTTGCGTTTCGAAATCATGGCGTTGTTTGATTGACAGCGACCGATTCATCAAAAACCACTTCCAAACCTCATCAAAAAACGCATCTTTGGCCCATCACAGGCATTTTTATTTTCTTGACTCGCACGTGGAGGCCGTCTCGGACAAGAAGGCCGTCTCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811576.1
MDNKSSKVSLLFLHEAIIEEILLRIPVRSLLRFRCVSKSWRCLIDSDRFIKNHFQTSSKNASLAHHRHFYFLDSHVEAVSDKKAVSDGDEESDSDEESHSNNEESESIHIVGCCNGLVCYWSNFGNLEKGYFELLNPATTITGRILPELELKIEDRVWSIGDCGFDWDESSGAHKVFVVLHWGNWDRMAKLYSSETNSWKTVIEVIDFENMGMYRTPVLSSGKLHWLRTHNIVTFDMKSEEFGVMERPHAPVVSLMRLDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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