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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002488`

染色体: Chr01 坐标: 42602545-42607511 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002488`
名称	SmilChr01G002488
描述	uncharacterized SmilChr01G002488
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42602545 - 42607511 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025808`
GeneID	`131025808`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025808`
原始查询	`LOC131025808`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Class I peptide chain release factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842585]; symbol=AT1G62850; hit=AT1G62850; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Class I peptide chain release factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842585]; symbol=AT1G62850; hit=AT1G62850; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G62850` (AT1G62850) Class I peptide chain release factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842585] identity=57.3; qcov=1.02; evalue=7.48e-86; confidence=high
Rice	`Os03g0249200` - identity=60.1; qcov=0.906; evalue=3.16e-82; confidence=high
GO	GO:0003747 (translation release factor activity); GO:0006415 (translational termination)
KEGG	-
Pfam	PF00472 (RF-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025808

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057811581.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057811581.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811581.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811581.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811581.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42603069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:42603212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:42607214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C85
`Chr1:42607303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811581.1

235 aa

118

235

RF-1

PF00472 RF-1 98-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811581.1`	Pfam	`PF00472`	RF-1	Domain	98	228	3.9e-19	69.4	RF-1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955598.1
CTAAAACAAGAAAAAAGAACAACAGACACAACACAATCGAGCTCATTCATTTCTTCAAATTTATGTGTCGCACTCCAAATTTCCCAAAAAAAAAAAAACAGAATATTACGATTTGGCAAGAAAAGAAGAAACTTTAATCCCTAATTAAGATTCAAATCTCTTTGCAGGGTTTATCAGTAATTCGATAATGGCAGCAATGAGAGCAGCACCTACCGCTGTGATGCTTGCTCGATCAATCTTCCGGCCTCCGCTTCATACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025808
ATGGCAGCAATGAGAGCAGCACCTACCGCTGTGATGCTTGCTCGATCAATCTTCCGGCCTCCGCTTCATACACAAGTCTCAGTTCGTTTGTTTCGCGGTACGTCGCCGGCCGGCGGCGTTACCGCGCTGCGGTGGCGAACGCCGACTGGTTACTGCGCTGTGAGGTGCCATTCTTCAAAATCCGGCGGCCAGGATAAGAAATCGCCTGCGCGGCTGGTGGAGGTTCAGCGACTTTTGCACGAAGCAGAGGAGCGGTATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811581.1
MAAMRAAPTAVMLARSIFRPPLHTQVSVRLFRGTSPAGGVTALRWRTPTGYCAVRCHSSKSGGQDKKSPARLVEVQRLLHEAEERYKAAGGGAEPIPQITLDHVSVSYARSSGPGGQNVNKVNTKVDMRFNVKKAHWLSEWVRERIMQMEKNRINKDGEIVISSTKTRTQKGNIEDALAKLQAIIDAASYVXPPPSQETVKKIAKLSAIGEQKRLDTKKSHSQKKALRRSRDSWD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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