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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002751`

染色体: Chr05 坐标: 31749761-31762304 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002751`
名称	SmilChr05G002751
描述	acyl-acyl carrier protein thioesterase ATL3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	31749761 - 31762304 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025809`
GeneID	`131025809`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025809`
原始查询	`LOC131025809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acyl-acyl carrier protein thioesterase ATL3, chloroplastic-like
产物	acyl-acyl carrier protein thioesterase ATL3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G68260` (AT1G68260) Thioesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843155] identity=45.2; qcov=0.942; evalue=3.12e-47; confidence=medium
Rice	`Os02g0659700` - identity=34.4; qcov=0.674; evalue=2.14e-19; confidence=low
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0016297 (fatty acyl-[ACP] hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03061 (4HBT); PF13279 (4HBT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025809

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811580.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811580.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811580.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811580.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:31749770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B11,B30,C54,D11
`Chr5:31762170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,C5,D6,D8
`Chr5:31762174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C11
`Chr5:31762200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B17
`Chr5:31762231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,B9,C5,D6
`Chr5:31762274`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr5:31762274`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr5:31762276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811580.1

190 aa

190

4HBT_2

4HBT

PF13279 4HBT_2 58-172 aa PF03061 4HBT 66-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811580.1`	Pfam	`PF13279`	4HBT_2	Domain	58	172	6.5e-13	49.9	Thioesterase-like superfamily
`XP_057811580.1`	Pfam	`PF03061`	4HBT	Domain	66	137	1.1e-07	32.7	Thioesterase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955597.1
TAATGTTGCACCACCCTTTTACTCGCATCACCACCACACACATCCCACTTGGCTTTCCCGCCATCGTCGCTGCCCACCAGCCACTAGCACCGTGGAGGAGATGTCGTCATCTTGCTTCTCATAGCATCAGGGGTGCCAAAGGGATGACTGGGTTTCATGAGATGGAACTACAAGTTCGAGAGTATGAGTTGGACCAGTTTGGAGTTGTGAATAATGCCGTTTACGCTAATTATTGTGAGATTGGTTTGTATCAAATCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025809
ATGTTGCACCACCCTTTTACTCGCATCACCACCACACACATCCCACTTGGCTTTCCCGCCATCGTCGCTGCCCACCAGCCACTAGCACCGTGGAGGAGATGTCGTCATCTTGCTTCTCATAGCATCAGGGGTGCCAAAGGGATGACTGGGTTTCATGAGATGGAACTACAAGTTCGAGAGTATGAGTTGGACCAGTTTGGAGTTGTGAATAATGCCGTTTACGCTAATTATTGTGAGATTGGTTTGTATCAAATCTCCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811580.1
MLHHPFTRITTTHIPLGFPAIVAAHQPLAPWRRCRHLASHSIRGAKGMTGFHEMELQVREYELDQFGVVNNAVYANYCEIGLYQISYMLDLINDGIVVAVKEASYKYIAPLRKKEKFLVKARVYDYSATRMYFEFFFLKLPNQEPILESKVTGVVLDKSFRPARIPPVVLSRINQLCSRETKERIRQHLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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