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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002785`

染色体: Chr05 坐标: 32555729-32556994 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002785`
名称	SmilChr05G002785
描述	uncharacterized SmilChr05G002785
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32555729 - 32556994 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025813`
GeneID	`131025813`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025813`
原始查询	`LOC131025813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=26.7; qcov=0.382; evalue=1.81e-18; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=24; qcov=0.425; evalue=5.18e-11; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025813

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811584.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057811584.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057811584.1`
4	P-body	P-body	0.40000	`XP_057811584.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811584.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32555729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr5:32555771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B118,B46,B61
`Chr5:32555797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B117,B33
`Chr5:32555798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:32555803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A14,A24,B121,B123,B26,B28,B61,B8,B89,C14,C16,C17,C26,C27,C36,C42,C64,C66,C86,C9,D7
`Chr5:32555833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B27,B99,C4,C75
`Chr5:32555865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B107,B125,B5,B62
`Chr5:32555903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B117,C77
`Chr5:32555906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:32555909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr5:32555915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr5:32555941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811584.1

421 aa

210

421

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 114-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811584.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	114	161	2.1e-07	31.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955601.1
ATGTGGAAGATTTCCTCGGAGTGGAAGTTGATCCCAATGTGTAAGGGCTTTTATATCTTGAAGTTTGATACAATGGAGGACAAAAACATTGTTAAGGCTCGAAAGTTATGGGATTTGTCGAAGGGATCCCTTCGTATGAGGGAGTGGGTGAAAGGGTTTAATCCCTATAAGGAAGTTTCTTCGTTGAGCCAAGTTTGGGTAAGAATATATAATCTTCCTGTGGAGTTCTGGCATCCTGAAGTTATCACAGCTATTGGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025813
ATGTGGAAGATTTCCTCGGAGTGGAAGTTGATCCCAATGTGTAAGGGCTTTTATATCTTGAAGTTTGATACAATGGAGGACAAAAACATTGTTAAGGCTCGAAAGTTATGGGATTTGTCGAAGGGATCCCTTCGTATGAGGGAGTGGGTGAAAGGGTTTAATCCCTATAAGGAAGTTTCTTCGTTGAGCCAAGTTTGGGTAAGAATATATAATCTTCCTGTGGAGTTCTGGCATCCTGAAGTTATCACAGCTATTGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811584.1
MWKISSEWKLIPMCKGFYILKFDTMEDKNIVKARKLWDLSKGSLRMREWVKGFNPYKEVSSLSQVWVRIYNLPVEFWHPEVITAIGNVVGTSIKIDGASAYADVGHYVRLLVEVDFSLPLQESMQVQGDDMAYHVEFYYEKLPLYCTHCRITGHSVDKCKKKQPRVENSDQVKVISEKEQVMTKGDNQTDPGAGFAKDKKFSLWKPKESDYTAASNAFASLADNEKFAMNGDIPGLDFANSPPAHKSGSISPRSGGCSGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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