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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002795`

染色体: Chr05 坐标: 32685250-32692853 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002795`
名称	SmilChr05G002795
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At2g16880-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32685250 - 32692853 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025814`
GeneID	`131025814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025814`
原始查询	`LOC131025814`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At2g16880-like
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At2g16880-like
Arabidopsis	`AT2G16880` (AT2G16880) Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816189] identity=39.4; qcov=0.505; evalue=3.1e-13; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01535 (PPR); PF13041 (PPR_2); PF13812 (PPR_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811586.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811586.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811586.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811586.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811586.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32685566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C47
`Chr5:32685573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,C19,C58,C80
`Chr5:32685642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B18,C30
`Chr5:32685655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr5:32685662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr5:32685663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,B69
`Chr5:32685672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C48
`Chr5:32685710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B115,B121,B32
`Chr5:32685711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B115,B121,B32
`Chr5:32685720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B100,B115,B121,B32
`Chr5:32685724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B115,B32
`Chr5:32685732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811586.1

206 aa

103

206

PPR_2

PPR

PPR_3

PF13041 PPR_2 142-189 aa PF01535 PPR 147-173 aa PF13812 PPR_3 148-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811586.1`	Pfam	`PF13041`	PPR_2	Repeat	142	189	1.2e-09	38.8	PPR repeat family
`XP_057811586.1`	Pfam	`PF01535`	PPR	Repeat	147	173	2.5e-06	28.0	PPR repeat
`XP_057811586.1`	Pfam	`PF13812`	PPR_3	Repeat	148	186	1.2e-06	29.2	Pentatricopeptide repeat domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955603.1
ATGCTGGAGGACAAGAATACTCCATTGATTTTGGGGCGTCCATTCCTAGCTACCGGTCGTGCTCTTATTGATGTACAGGATGGAGATCTCACATTTAGAGTCAATGATGAAAAATTGACTCTATCTATCTATGACGCTATGAGAAAACCAGCCGAGCCGCAGATGGATGAGTGCAACATGATTGAATCTGTGATTGATTTCCCTGCAGCTGTAGACGATCCCTTGGAGGAGTGCATCATACGATTGCCGGCGAAGAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025814
ATGCTGGAGGACAAGAATACTCCATTGATTTTGGGGCGTCCATTCCTAGCTACCGGTCGTGCTCTTATTGATGTACAGGATGGAGATCTCACATTTAGAGTCAATGATGAAAAATTGACTCTATCTATCTATGACGCTATGAGAAAACCAGCCGAGCCGCAGATGGATGAGTGCAACATGATTGAATCTGTGATTGATTTCCCTGCAGCTGTAGACGATCCCTTGGAGGAGTGCATCATACGATTGCCGGCGAAGAGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811586.1
MLEDKNTPLILGRPFLATGRALIDVQDGDLTFRVNDEKLTLSIYDAMRKPAEPQMDECNMIESVIDFPAAVDDPLEECIIRLPAKSHRLGLVASAIFCFAPGLVISAPASWPLPSSAIVSEHPHHHLHRYLLHPARPLPPPSATLLNTCIFAYCRSGWPHLATQLFKKMKRLKIRPNLLTLNTLLNSLMHCLRRGNYTICTICCMV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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