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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002807`

染色体: Chr05 坐标: 32860759-32862901 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002807`
名称	SmilChr05G002807
描述	uncharacterized SmilChr05G002807
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32860759 - 32862901 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025816`
GeneID	`131025816`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025816`
原始查询	`LOC131025816`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=22.7; qcov=0.841; evalue=1.28e-28; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=29.1; qcov=0.924; evalue=7.17e-72; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025816

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811588.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811588.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811588.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811588.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811588.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32860777`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	55	A10,A14,A15,A19,A7,B103,B104,B105,B109,B111,B114,B123,B127,B132,B133,B137,B138,B28,B33,B34,B4,B46,B50,B60,B66,B71,B72,B76,B79,B81,B88,C1,C12,C14,C15,C17,C22,C27,C30,C34,C39,C49,C5,C54,C57,C64,C66,C70,C75,C8,C86,C9,D10,D2,D3
`Chr5:32860782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B120,B125,B33
`Chr5:32860862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B22,B4
`Chr5:32860862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B4
`Chr5:32860865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr5:32860877`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B33
`Chr5:32860877`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B33
`Chr5:32860959`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	34	A13,A16,A20,A4,A8,B106,B118,B12,B122,B126,B129,B131,B136,B139,B19,B3,B37,B38,B39,B41,B46,B51,B58,B67,B79,B84,C10,C15,C17,C25,C26,C36,C4,C45
`Chr5:32860970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B66
`Chr5:32860988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C61
`Chr5:32861029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:32861031`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A21,A9,B104,B119,B123,B134,B21,B87,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811588.1

602 aa

301

602

SWIM

PF04434 SWIM 335-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811588.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	335	359	4.1e-07	30.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955605.1
ATGAACAATAAGCTAGTTAGTAGCAAGTGGATAGCAAAGAGATATGTTAATGTGTTTAGAATTAGGAACAATATCACCATTCCAGAATTGAGAGATGACATCTGGAGAAGGTTTGCAACAAAAGTTGCCAGAGATAGGCTTTACAAAGCTATGTCTATTGCCCAACAATTGGTTAGGAGGACAGTCACTGAGCATTATGGACTTGTGAGGAGTTACATTGTAGAGAGTAGAAGGGTAGATCCCACTGGTAGATTTGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025816
ATGAACAATAAGCTAGTTAGTAGCAAGTGGATAGCAAAGAGATATGTTAATGTGTTTAGAATTAGGAACAATATCACCATTCCAGAATTGAGAGATGACATCTGGAGAAGGTTTGCAACAAAAGTTGCCAGAGATAGGCTTTACAAAGCTATGTCTATTGCCCAACAATTGGTTAGGAGGACAGTCACTGAGCATTATGGACTTGTGAGGAGTTACATTGTAGAGAGTAGAAGGGTAGATCCCACTGGTAGATTTGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811588.1
MNNKLVSSKWIAKRYVNVFRIRNNITIPELRDDIWRRFATKVARDRLYKAMSIAQQLVRRTVTEHYGLVRSYIVESRRVDPTGRFELITGEGRVFKALYMGYTALRKGFQVGCRRILGLDGCFLKTCLGRILLSAVAKDDLEITDGQGWTFLSDQQKGLENVVATIVSHAEHRNCARHVYMNWKKQGHTGSTLKNIFWRAVKASYKDEYKRAMEEMKAESVAAYQDFREMDVHRFCKAFLPTTTFSYMIDNNIAETFNGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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