当前解析结果
SmilChr05G002837| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002837 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002837 |
| 描述 | uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 33710784 - 33711275 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025826 |
|---|---|
| GeneID | 131025826 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025826 |
| 原始查询 | LOC131025826 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=medium |
| 产物 | orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=medium |
| Arabidopsis | ATMG00810- identity=39; qcov=1.04; evalue=7.57e-35; confidence=medium |
| Rice | gene-orf490 (orf490)- identity=43.8; qcov=0.994; evalue=3.57e-37; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025826 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811596.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057811596.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811596.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811596.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811596.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:33710799 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C22 |
Chr5:33710814 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 13 | B1,B102,B115,B121,B32,B54,B65,B68,B89,C26,C36,C87,D4 |
Chr5:33710827 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
Chr5:33710841 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 37 | A25,B102,B107,B111,B115,B119,B128,B132,B138,B139,B140,B15,B18,B24,B4,B62,B64,B84,B88,C1,C19,C25,C34,C40,C41,C43,C49,C51,C6,C65,C67,C71,C77,C80,D3,D7,D9 |
Chr5:33710853 |
GCC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A9,B128,B133,B35,B42,C30,C51,C76,C84 |
Chr5:33710858 |
A |
AAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 8 | A9,B128,B133,B35,C30,C51,C76,C84 |
Chr5:33710903 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B83 |
Chr5:33710930 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
Chr5:33710934 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 23 | A11,A2,A24,A3,A7,B135,B17,B33,B52,B70,B82,B99,C11,C2,C29,C47,C54,C69,C7,C75,C78,C82,C9 |
Chr5:33710941 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr5:33711006 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C7,C73 |
Chr5:33711020 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。