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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002842`

染色体: Chr05 坐标: 33764585-33765611 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002842`
名称	SmilChr05G002842
描述	uncharacterized SmilChr05G002842
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	33764585 - 33765611 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025827`
GeneID	`131025827`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025827`
原始查询	`LOC131025827`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01107 (MP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025827

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811597.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057811597.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057811597.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811597.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811597.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:33764698`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	125	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A2,A20,A21,A22,A24,A4,A8,A9,B101,B103,B104,B109,B113,B114,B118,B119,B12,B120,B121,B123,B124,B126,B128,B13,B130,B131,B134,B136,B138,B139,B14,B16,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B26,B29,B30,B35,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B46,B50,B51,B52,B53,B55,B57,B58,B6,B60,B64,B65,B67,B7,B73,B79,B80,B83,B84,B86,B87,B92,B94,B95,B97,B99,C10,C12,C15,C16,C19,C2,C21,C25,C26,C3,C31,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C42,C45,C5,C51,C54,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C64,C67,C68,C71,C73,C74,C77,C78,C8,C81,C82,C86,D10,D11,D8,D9
`Chr5:33764700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,B87
`Chr5:33764712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B118,B18,B86,D11
`Chr5:33764714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	158	A10,A14,A15,A18,A19,A20,A23,A24,A3,A5,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B12,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B140,B15,B17,B2,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B31,B32,B34,B35,B36,B37,B4,B42,B43,B44,B45,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B57,B59,B60,B61,B66,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B86,B87,B88,B89,B90,B92,B93,B96,B99,C1,C11,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C20,C22,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C55,C57,C59,C6,C62,C64,C66,C68,C69,C70,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C8,C83,C86,C87,C9,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D9
`Chr5:33764800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B31,B38,B52,C80
`Chr5:33764810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A14,B28,B31,B34,B93,C11,C21,C22,C24,C42,C68,D10
`Chr5:33764836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B134,B137
`Chr5:33764864`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C38
`Chr5:33764864`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C38
`Chr5:33764873`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B74,B77,D3
`Chr5:33764873`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B74,B77,D3
`Chr5:33764900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811597.1

313 aa

156

313

PF01107 MP 24-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811597.1`	Pfam	`PF01107`	MP	Family	24	184	1e-27	97.7	Viral movement protein (MP)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955614.1
ATGGATATACAAACATTTCAAGGGTTTTCAAGAGGAAGATTGGATCAAGTTCTACAAAGCTTGAGTCCATTCAAAAGGAAGCATCATGTCTTCTTCAGTACAATGAGTCGGGAGTTGGCACTTCCAATAGAAATAACGAACAACCAAGTAGAGATCCAATTAATTCCAGCCGAAGATGTGCGGATAGATCTCTCAAAAATGAAGCCAGAAGTCACTAGAACGATGAAATTGATTCATATTGGAGCAATCCAGTTGGTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025827
ATGGATATACAAACATTTCAAGGGTTTTCAAGAGGAAGATTGGATCAAGTTCTACAAAGCTTGAGTCCATTCAAAAGGAAGCATCATGTCTTCTTCAGTACAATGAGTCGGGAGTTGGCACTTCCAATAGAAATAACGAACAACCAAGTAGAGATCCAATTAATTCCAGCCGAAGATGTGCGGATAGATCTCTCAAAAATGAAGCCAGAAGTCACTAGAACGATGAAATTGATTCATATTGGAGCAATCCAGTTGGTAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811597.1
MDIQTFQGFSRGRLDQVLQSLSPFKRKHHVFFSTMSRELALPIEITNNQVEIQLIPAEDVRIDLSKMKPEVTRTMKLIHIGAIQLVIKSSLSPGTDTPIDVAICDKRITNPRDAVLGAFSGNLYAKKIVTELYPQIAYNLQDLAFSRALTLYQDYKRKDLLTGGNRSYSITYQVSYALSNSHHTDLFLGKNFIEVSEVFKEVAKAISPDRVEIPKIREIGIQVGDKQVLKHNQSLRLGAPRLSFQGDRLTSRPLERSFSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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