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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002492`

染色体: Chr01 坐标: 42663571-42665645 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002492`
名称	SmilChr01G002492
描述	IRK-interacting protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42663571 - 42665645 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025836`
GeneID	`131025836`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025836`
原始查询	`LOC131025836`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	IRK-interacting protein
产物	IRK-interacting protein
Arabidopsis	`AT1G12330` (AT1G12330) cyclin-dependent kinase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837787] identity=54; qcov=0.963; evalue=7.71e-171; confidence=high
Rice	`Os08g0508100` - identity=38.7; qcov=0.852; evalue=1.56e-81; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24994 (GIL1_IRKI_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025836

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057811606.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811606.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811606.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811606.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811606.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42664089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B3
`Chr1:42664091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:42664106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B98,C13,C49
`Chr1:42664114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B104,B132,B136,B9
`Chr1:42664118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B101
`Chr1:42664128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,C84
`Chr1:42664134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B32,C50,C71
`Chr1:42664135`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A23,B139,B34,B94,B97,C73,D5
`Chr1:42664163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,C70,D10,D2
`Chr1:42664166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B131,C15,C46
`Chr1:42664190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:42664193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B67,C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811606.1

492 aa

246

492

GIL1_IRKI_C

PF24994 GIL1_IRKI_C 414-464 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811606.1`	Pfam	`PF24994`	GIL1_IRKI_C	Domain	414	464	1.5e-07	32.0	GIL1/IRKI C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955623.1
CGTGACTTCTGACCCCGCTGCATTTACTGATTGTTCTGTTCCTGCATTTGGGGTAGATAGATCAACATCCAAATAAACTCACTAAATTTGCTTACAAAAACTCAAATCTCTAATTCTTTCAACAATAACATTTGGTGGATTGTTGCAGCTTATTTCGCTGATAGAGAATATGATAGAGAGAGAGTGACAGCCCATGCAAGAATCGGCGCTCTGAAATTGTTGTTTAACTTGATTCATTTTTTTACATGAAGAAGAATCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025836
ATGAAATCCATGGCGACTTCTTCTTCTTCCTCATCCAAAACCTCCCTCTCCCCGCACCACCCTCCCCACTTCACTCCGATTGAAGAGGGGAACGAGGAGGAAGAATTCTCGCAGGGGAGGATGAGTTTCAGAGCAACTCCGGCGAGCGACTACACGGAGAAGAGAGACAGCGATTACACGCACTTTCCGACGCCGCTGAATTCCGAGAAGAGCCGGCGGAGCAGCAAGACGGCGAAGAAGCGGCAGGAAAAGGAGGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811606.1
MKSMATSSSSSSKTSLSPHHPPHFTPIEEGNEEEEFSQGRMSFRATPASDYTEKRDSDYTHFPTPLNSEKSRRSSKTAKKRQEKEEASGVSCNKCRPSNRERFSVVPLESNNGGRLSMASPNGIFKSILASLALKRSPKSSGSAASSSSREEHWKIVVAELSNKLIQASRRRDEAVLEASKLKYSMAELEKKLNKLEIYCHNLKSELETCTTSHQKQQHKSPSRIMNYQLIKVGDQSKVIEHFLVSVSETRSSVRFLARA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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