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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002876`

染色体: Chr05 坐标: 34440934-34443662 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002876`
名称	SmilChr05G002876
描述	uncharacterized SmilChr05G002876
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	34440934 - 34443662 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025837`
GeneID	`131025837`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025837`
原始查询	`LOC131025837`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430]; symbol=AT2G05642; hit=AT2G05642; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430]; symbol=AT2G05642; hit=AT2G05642; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G05642` (AT2G05642) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819430] identity=24.2; qcov=0.39; evalue=8.59e-09; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02721 (DUF223); PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025837

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811604.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811604.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811604.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811604.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811604.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:34440965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B17,C4
`Chr5:34441019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr5:34441082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D6
`Chr5:34441110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:34441187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:34441438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,C33,D10,D3
`Chr5:34441442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr5:34441684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:34441801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr5:34441877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C22
`Chr5:34441885`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A21,A23,B108,B60,C22,C58,C67,C83
`Chr5:34441902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811604.1

403 aa

202

403

DUF223

Rep_fac-A_C

PF02721 DUF223 10-126 aa PF08646 Rep_fac-A_C 222-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811604.1`	Pfam	`PF02721`	DUF223	Domain	10	126	9.5e-11	42.6	Domain of unknown function DUF223
`XP_057811604.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	222	342	6.1e-13	49.5	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955621.1
ATGGCACTTGTGTATACCAAAATTGTGGATTTGCATCCTTCTGTAACAAATTCGATGATAAAAGTCATATGCATTCGTCGCTATGCTATCAAGTATGGAGGGGAACAATCCTCTATTGAATGTGTGGAGCATGATCGTGAGGGTACAAGAATTCATTTGACTATACCACGTGGACAGTGTGGTGCACTTGGGCATATTATGCAAGAGGATGTTGTTGTGCAAATTAGGAATTTTTTTGTGCGAAATAACAACTTTGTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025837
ATGGCACTTGTGTATACCAAAATTGTGGATTTGCATCCTTCTGTAACAAATTCGATGATAAAAGTCATATGCATTCGTCGCTATGCTATCAAGTATGGAGGGGAACAATCCTCTATTGAATGTGTGGAGCATGATCGTGAGGGTACAAGAATTCATTTGACTATACCACGTGGACAGTGTGGTGCACTTGGGCATATTATGCAAGAGGATGTTGTTGTGCAAATTAGGAATTTTTTTGTGCGAAATAACAACTTTGTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811604.1
MALVYTKIVDLHPSVTNSMIKVICIRRYAIKYGGEQSSIECVEHDREGTRIHLTIPRGQCGALGHIMQEDVVVQIRNFFVRNNNFVRNKTVDNPYRIVLFPKSQMSACVDPDFPLQKFLFKDFNDISAIEDANEEVLFDVIGVLVGKRYIKDQNNVKLIELVLEDARPTLYKVSVGIKFSKKTLSLNLETVKEDSVSDEDINVKAIDEIVTNENGEAWICGTIESVDCSYTWCYMACIRCTRKVAKLNNRFFCGACNKYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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