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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002493`

染色体: Chr01 坐标: 42676562-42679976 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002493`
名称	SmilChr01G002493
描述	deoxyribodipyrimidine photo-lyase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42676562 - 42679976 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025842`
GeneID	`131025842`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025842`
原始查询	`LOC131025842`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	deoxyribodipyrimidine photo-lyase
产物	deoxyribodipyrimidine photo-lyase
Arabidopsis	`AT1G12370` (PHR1) photolyase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837792] identity=71.7; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0167600` (qUVR-10) - identity=64.1; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000719 (photoreactive repair); GO:0003904 (deoxyribodipyrimidine photo-lyase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00875 (DNA_photolyase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025842

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811611.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057811611.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057811611.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811611.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42676800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B126,B61,B65
`Chr1:42678010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B78
`Chr1:42678096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C8,C83
`Chr1:42678494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr1:42678855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811611.1

489 aa

244

489

DNA_photolyase

PF00875 DNA_photolyase 28-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811611.1`	Pfam	`PF00875`	DNA_photolyase	Domain	28	190	9e-31	107.8	DNA photolyase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955628.1
AAAGAATCCTACGTGTCCACCTTCAAAACCACAAGCGTTAGCCGTTTGAATTCCCTCCATTTCATCGCTCCCTCCCTCGCTTTCCCTTCTCTCTCATTCAACCCTACACTCCCCCGGCGCACAATAGCTCAACCTAATGTCTTCCTTGATTCCACCCGTCCAGCCTGGCAGGATCCGGGTCCTCAAGCAAGGGTCCGACCCGAACCAGGCGGGGCCGGTGGTGTACTGGATGTTCAGGGATCAACGGCTGCGGGACAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025842
ATGTCTTCCTTGATTCCACCCGTCCAGCCTGGCAGGATCCGGGTCCTCAAGCAAGGGTCCGACCCGAACCAGGCGGGGCCGGTGGTGTACTGGATGTTCAGGGATCAACGGCTGCGGGACAACTGGGCTCTGATCCACGCCGTCCATCAAGCCAACCTGCTCGAGGTGCCCCTCGCCATCGCTTTCAACCTCTTCCGTCACTTCAAGGGCGCCAAAGCTCGTCAATTAGGGTTTATGCTCAGAGGCCTCGAGAAATTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811611.1
MSSLIPPVQPGRIRVLKQGSDPNQAGPVVYWMFRDQRLRDNWALIHAVHQANLLEVPLAIAFNLFRHFKGAKARQLGFMLRGLEKLHSDLRSTLHVPFFLFQGEAVDTIPKFLKETGASLLVTDFSPLREVRQWKEEICKRVTESVSIHEVDAHNVVPIWVASDKLEYAARTLRGKINKKLPEYLIDFPEVTSPIKRWDFSSNSIEWEDLIASVLRQGAEVPELEWCEPGEKAAMEVLMGDKSGFLKARLKNYSSDRNNP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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