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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002922`

染色体: Chr05 坐标: 35173982-35176679 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002922`
名称	SmilChr05G002922
描述	uncharacterized SmilChr05G002922
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35173982 - 35176679 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025844`
GeneID	`131025844`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025844`
原始查询	`LOC131025844`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=28.3; qcov=0.405; evalue=3.21e-25; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=26.6; qcov=0.682; evalue=4.99e-39; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025844

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811612.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811612.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811612.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811612.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35173984`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	116	A1,A13,A15,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A5,B102,B104,B105,B106,B108,B11,B110,B111,B114,B117,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B23,B25,B27,B29,B3,B31,B34,B35,B41,B47,B48,B53,B57,B60,B65,B66,B7,B71,B73,B77,B78,B79,B8,B86,B88,B93,B95,C1,C14,C17,C18,C19,C2,C20,C24,C25,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C34,C36,C37,C40,C46,C48,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C80,C82,C84,C86,C9,D10,D3,D7,D9
`Chr5:35173986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B10,B114,B117,B13,B28,B4,B75,C20,C30,C40,C50,C70,C73,C76,D4
`Chr5:35173988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B69,B80
`Chr5:35174078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B75,C65,C71
`Chr5:35174103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:35174109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B122,B21,B58
`Chr5:35174109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B21,B58
`Chr5:35174126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B40,C35
`Chr5:35174141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:35174177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	47	A15,A22,B101,B102,B104,B106,B120,B124,B132,B140,B16,B2,B23,B27,B31,B34,B42,B43,B50,B55,B56,B67,B69,B78,B85,B86,B93,B94,B96,C13,C16,C20,C27,C42,C45,C46,C50,C51,C52,C59,C62,C63,C68,C74,C81,C83,C85
`Chr5:35174183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B39
`Chr5:35174183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811612.1

699 aa

350

699

RVT_1

zf-RVT

PF00078 RVT_1 257-436 aa PF13966 zf-RVT 589-662 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811612.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	257	436	1.5e-12	48.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057811612.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	589	662	1.2e-12	49.0	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955629.1
ATGTGGGTGCTGCACCCTTCCTTCTGCGATATGGTCGAGAATTCTTGGTTGAGCTCTGTGGACGTCCTCTGTCCTATAGTCCGTGTTATGTTGAAGCTTAAAAGATTGTGTGCTGATATTAGGGTCTGGAACAAGGAGGTGTTTGGAAATGTCGACATTGCTTTGAATCAATGGAAGCAACAACTGTTGGTTACTCAGATGCAAATTGCTGATTCAGGTTATACGGATGATTTATTTGATGAAGAAGTGCAACTCCAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025844
ATGTGGGTGCTGCACCCTTCCTTCTGCGATATGGTCGAGAATTCTTGGTTGAGCTCTGTGGACGTCCTCTGTCCTATAGTCCGTGTTATGTTGAAGCTTAAAAGATTGTGTGCTGATATTAGGGTCTGGAACAAGGAGGTGTTTGGAAATGTCGACATTGCTTTGAATCAATGGAAGCAACAACTGTTGGTTACTCAGATGCAAATTGCTGATTCAGGTTATACGGATGATTTATTTGATGAAGAAGTGCAACTCCAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811612.1
MWVLHPSFCDMVENSWLSSVDVLCPIVRVMLKLKRLCADIRVWNKEVFGNVDIALNQWKQQLLVTQMQIADSGYTDDLFDEEVQLQAELNVALSRKSNLLQQKSRATWLSDGDSNTDFFHWLTKFKKRNNTFTRLNINGADVYDSGIIEQHIVSHFSELFTDDGSALADQLEIDALIQPRISDDQNNLLIQIPDEGEIAAAVFGKDAHSVPGSDDFSGMFFHNCWSTIKADIILAVQRFFSHSYLPSGCNASTMIFIPKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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