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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002956`

染色体: Chr05 坐标: 35710990-35712081 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002956`
名称	SmilChr05G002956
描述	uncharacterized SmilChr05G002956
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35710990 - 35712081 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025854`
GeneID	`131025854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025854`
原始查询	`LOC131025854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=44.1; qcov=0.256; evalue=1.98e-23; confidence=weak
Rice	`Os06g0597250` - identity=46.4; qcov=0.956; evalue=9e-110; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811622.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811622.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811622.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811622.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35710990`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B107,B117,B31,B33,B46,B80,C28,C75,C9
`Chr5:35711002`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr5:35711002`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr5:35711038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B81,C25,C42,C62
`Chr5:35711054`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B38
`Chr5:35711054`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B38
`Chr5:35711069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B47,C27,C56
`Chr5:35711100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B111,C55
`Chr5:35711147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B76,B81,C37,D10
`Chr5:35711152`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B135,B23,B44,B66,B69
`Chr5:35711152`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B135,B23,B44,B66,B69
`Chr5:35711158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A10,A14,A15,A7,A9,B103,B105,B109,B111,B114,B123,B133,B137,B138,B28,B32,B34,B50,B55,B66,B73,B76,B78,B79,B81,C1,C11,C12,C14,C15,C17,C22,C23,C27,C30,C34,C39,C43,C57,C69,C71,C86,C87,C9,D10,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811622.1

363 aa

182

363

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 66-104 aa PF04827 Plant_tran 171-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811622.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	66	104	2.7e-15	56.6	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057811622.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	171	360	9e-88	293.9	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955639.1
ATGGCCTATAGCTCAAATATTGATGCTTCAAATTCTAGCGATGATGAAGCATGGGAACAAAGCGTTGCCGAACATAATCGCCAACTTGACCGCATCATTGAGGATGTGGTCATCCATGCCGCAAGTCTATATGTACAACCTACCAATCATGTCGTTAGAGCAAGGGGGCAGTATATTGAAAGAAAACGTGAGATAGGTCATGAAGGTGTGTTTGAGCAGTACTTTTTAGAAGATCCAATCTATCCCCCAGAATATTTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025854
ATGGCCTATAGCTCAAATATTGATGCTTCAAATTCTAGCGATGATGAAGCATGGGAACAAAGCGTTGCCGAACATAATCGCCAACTTGACCGCATCATTGAGGATGTGGTCATCCATGCCGCAAGTCTATATGTACAACCTACCAATCATGTCGTTAGAGCAAGGGGGCAGTATATTGAAAGAAAACGTGAGATAGGTCATGAAGGTGTGTTTGAGCAGTACTTTTTAGAAGATCCAATCTATCCCCCAGAATATTTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811622.1
MAYSSNIDASNSSDDEAWEQSVAEHNRQLDRIIEDVVIHAASLYVQPTNHVVRARGQYIERKREIGHEGVFEQYFLEDPIYPPEYFRTRFRMRKPLFERIMNRLVAIDKFFQQHPDAAGRLGMSPIQKCTAVLAYNTSTDLHDEYLRMRAQVIRKSIIKFVEGVISNFGAEYLKRPTEEDMTAFLHIGERRGFPRVMGSIDCMHWEWKNCPTAWAGQYAGRSATPIIILEAVASQDLWIWHAFFETPGLRNDINVLDQSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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