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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002960`

染色体: Chr05 坐标: 35798888-35799673 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002960`
名称	SmilChr05G002960
描述	uncharacterized SmilChr05G002960
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35798888 - 35799673 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025856`
GeneID	`131025856`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025856`
原始查询	`LOC131025856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0930300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os01g0930300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G42905` (AT5G42905) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834302] identity=40.2; qcov=0.352; evalue=9.13e-11; confidence=low
Rice	`Os01g0930300` - identity=23.1; qcov=0.927; evalue=5.69e-13; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025856

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811625.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811625.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811625.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811625.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811625.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35798951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,C35,C5,C51,C6
`Chr5:35798956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,C35,C5,C51,C6
`Chr5:35798973`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B30,B62,B75,C35,C5,C51,C6
`Chr5:35799066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B103,C12,C57
`Chr5:35799067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,B65,B80
`Chr5:35799076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr5:35799096`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A3,B66,B89
`Chr5:35799096`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A3,B66,B89
`Chr5:35799100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:35799107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C39
`Chr5:35799115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,D4
`Chr5:35799151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811625.1

261 aa

130

261

RVT_3

PF13456 RVT_3 109-229 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811625.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	109	229	2e-17	64.0	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955642.1
ATGGTTAGCGCCTGGTCTTTGGATAGCAGTTCGTTGATCAAAGCTTTTTGGAAGGCGGGCATTGTTAACATTTTGTGGAAAATATGGGATTGTCGTAATCATGTTATTTTTGATGATTTGGAGTTTAATATCATTATGATTAGAAGTTTTATCAAGGTGAGTTTTAGAGAGATGGATCGGCACTTCAAGAAGTTGGGTAACTCCAATAATACCTGGTCGGATTATCTCATTTTGCGTTCTATTGGTGTGGCTACTCGCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025856
ATGGTTAGCGCCTGGTCTTTGGATAGCAGTTCGTTGATCAAAGCTTTTTGGAAGGCGGGCATTGTTAACATTTTGTGGAAAATATGGGATTGTCGTAATCATGTTATTTTTGATGATTTGGAGTTTAATATCATTATGATTAGAAGTTTTATCAAGGTGAGTTTTAGAGAGATGGATCGGCACTTCAAGAAGTTGGGTAACTCCAATAATACCTGGTCGGATTATCTCATTTTGCGTTCTATTGGTGTGGCTACTCGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811625.1
MVSAWSLDSSSLIKAFWKAGIVNILWKIWDCRNHVIFDDLEFNIIMIRSFIKVSFREMDRHFKKLGNSNNTWSDYLILRSIGVATRAKPPPTMIEVYWWPPAVSWMKVNTDGSAHGAPGSIAAGGVFRDSWGWVRGYFHFKGGRGFAFEAELLAVIHAISIAHNRGWFSLWVEADSEYVVRLLQARSMDVPWRFMGLWKQAIMKISDFNLQVLHIYREGNRAADIMANQDREEGWWPFAIEEIKLATNLDMATHSAIRIK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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