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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002980`

染色体: Chr05 坐标: 36333557-36334765 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002980`
名称	SmilChr05G002980
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	36333557 - 36334765 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025860`
GeneID	`131025860`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025860`
原始查询	`LOC131025860`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=33.8; qcov=0.803; evalue=7.7e-53; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=39.9; qcov=0.774; evalue=1.4e-70; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025860

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811630.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811630.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811630.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811630.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811630.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:36333616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A1,B21,B31,B44,B74,C37,C51,C6,C77,C82
`Chr5:36333617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C75,C76,D4
`Chr5:36333646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B121,B54,C26,C36
`Chr5:36333646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B54,C26,C36
`Chr5:36333667`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A15,B100,B119,B133,B139,B24,B66,B84,C41,D5
`Chr5:36333672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,C32,C68,C69
`Chr5:36333675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C35
`Chr5:36333683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A19,B110,B13,B43,B60,C2,C32,C68
`Chr5:36333688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,C10,C7,C84,D3
`Chr5:36333693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B2,C4,C67
`Chr5:36333711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr5:36333757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,C22,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811630.1

402 aa

201

402

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 103-193 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 285-398 aa PF10551 MULE 315-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811630.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	103	193	3.1e-16	60.6	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057811630.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	285	398	1.7e-09	38.4	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057811630.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	315	402	8.1e-25	87.8	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955647.1
ATGGATTTTGATTTGAACGAGTATCCATCTAATGAGGTTGGCGATGAAGATGAAGTATTGTCAAGGAAGGAAGCATTTGTTGATGAAAATAATGTTGAAAATAGAAATGAAGATTGTGATGATAATTCAGATGTTGGAGACGGAGATAAGGATCAAAGTCTTGAAGAAGTTGAGGAAAATGTTGAAGATGAGCAACATGTTGAGCACGATTGTGGCAAATTTGCCGATCTACTTAATAGGATTGATGTACTTGAGATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025860
ATGGATTTTGATTTGAACGAGTATCCATCTAATGAGGTTGGCGATGAAGATGAAGTATTGTCAAGGAAGGAAGCATTTGTTGATGAAAATAATGTTGAAAATAGAAATGAAGATTGTGATGATAATTCAGATGTTGGAGACGGAGATAAGGATCAAAGTCTTGAAGAAGTTGAGGAAAATGTTGAAGATGAGCAACATGTTGAGCACGATTGTGGCAAATTTGCCGATCTACTTAATAGGATTGATGTACTTGAGATGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811630.1
MDFDLNEYPSNEVGDEDEVLSRKEAFVDENNVENRNEDCDDNSDVGDGDKDQSLEEVEENVEDEQHVEHDCGKFADLLNRIDVLEMVLEVGKSVNDPEAAYILYCEYARLKGFSVTRDNKGYFNRTKICSYQTFLCSCHGKSETKTSLDRGMATYNKQDRKTMCKAKLRVSRRRNQPWKVRSWYKEHNHELFPSDQSYLLRSARSLSKSKKLLIEAMNSAGIGISRACAFIEKESGGPQNCGFTRKGAYNHINGTKMKTK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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