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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002985`

染色体: Chr05 坐标: 36400500-36402530 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002985`
名称	SmilChr05G002985
描述	uncharacterized SmilChr05G002985
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	36400500 - 36402530 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025861`
GeneID	`131025861`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025861`
原始查询	`LOC131025861`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0142900` - identity=36.5; qcov=0.308; evalue=5.81e-32; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025861

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811631.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811631.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811631.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811631.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811631.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:36400504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B99
`Chr5:36400509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	25	A13,A18,A3,B105,B12,B16,B25,B35,B49,B51,B56,B6,B62,B72,B81,B87,C20,C24,C3,C39,C44,C56,C83,D7,D9
`Chr5:36400526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A3,C74
`Chr5:36400543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B14,B66,B99
`Chr5:36400552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,B64
`Chr5:36400555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr5:36400557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B39,C37,C78,D1
`Chr5:36400565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B67,C74
`Chr5:36400571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C77,D1
`Chr5:36400572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr5:36400590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C68
`Chr5:36400590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811631.1

676 aa

338

676

Asp_protease_2

RVT_1

PF13650 Asp_protease_2 205-295 aa PF00078 RVT_1 545-675 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811631.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	205	295	1.6e-06	29.4	Aspartyl protease
`XP_057811631.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	545	675	2.9e-22	80.2	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955648.1
ATGACCAAACAGAGCATGGAATCCCAGTCGGCTACTATCAAGCGTCTAGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTCCGGGACATTGAACCAGATGCAACAGCAGCAACAACCAGGGAAACTCCATGGACAAGGATTGCAACCTCATCAAGATCAAGCTGTCACAGTCCTACGGAGTGGAAAGAAGGTGGACAACAAAGTGGAGATCCCTACTGACGAGCCTCCCAAGAAAACCTGTGGGAAGGAGATGGTGAAAGAAGTGCCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025861
ATGACCAAACAGAGCATGGAATCCCAGTCGGCTACTATCAAGCGTCTAGAGACAACCGTTGGGCAGCTCTCCGGGACATTGAACCAGATGCAACAGCAGCAACAACCAGGGAAACTCCATGGACAAGGATTGCAACCTCATCAAGATCAAGCTGTCACAGTCCTACGGAGTGGAAAGAAGGTGGACAACAAAGTGGAGATCCCTACTGACGAGCCTCCCAAGAAAACCTGTGGGAAGGAGATGGTGAAAGAAGTGCCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811631.1
MTKQSMESQSATIKRLETTVGQLSGTLNQMQQQQQPGKLHGQGLQPHQDQAVTVLRSGKKVDNKVEIPTDEPPKKTCGKEMVKEVPPPREEEQQGEPSVKLHKATKPYRPPIPYPGRLRNEKHDQQFTDFYNMLAKVNVNLPLLDVIRNVPAYVKFFKELASKKRKFVDNEKILVSEVANSIMQQPLPPKQRDPGSFVINIALGNGKETSGMLDLGAGINLMPYSIFKQLELGDLKPTRMCLQLADRSVRYPRGVIEDIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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