当前解析结果
SmilChr01G002496| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002496 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002496 |
| 描述 | methylsterol monooxygenase 1-1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 42756988 - 42761406 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025862 |
|---|---|
| GeneID | 131025862 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025862 |
| 原始查询 | LOC131025862 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | methylsterol monooxygenase 1-1-like |
| 产物 | methylsterol monooxygenase 1-1-like |
| Arabidopsis | AT4G12110 (SMO1-1)sterol-4alpha-methyl oxidase 1-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826819] identity=72.7; qcov=0.964; evalue=2.83e-166; confidence=high |
| Rice | Os10g0545200 (OsGL1-10)- identity=68.5; qcov=0.97; evalue=7.39e-150; confidence=high |
| GO | GO:0000254 (C-4 methylsterol oxidase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016126 (sterol biosynthetic process) |
| KEGG | smil00100 (Steroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF04116 (FA_hydroxylase) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025862 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057811632.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057811632.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057811632.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811632.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811632.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057811632.1PF04116
FA_hydroxylase 132-265 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057811632.1 |
Pfam | PF04116 |
FA_hydroxylase | Domain | 132 | 265 | 3.8e-28 | 99.3 | Fatty acid hydroxylase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。