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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002499`

染色体: Chr01 坐标: 42825629-42827924 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002499`
名称	SmilChr01G002499
描述	uncharacterized protein At4g22758
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42825629 - 42827924 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025867`
GeneID	`131025867`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025867`
原始查询	`LOC131025867`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0448600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os02g0448600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G22758` (AT4G22758) PPR containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:10723027] identity=36.1; qcov=0.793; evalue=4.57e-28; confidence=medium
Rice	`Os02g0448600` - identity=45.3; qcov=0.709; evalue=4.2e-31; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23156 (DUF7054)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025867

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811637.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057811637.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811637.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811637.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811637.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42825879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr1:42825926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C70
`Chr1:42825934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C65
`Chr1:42826014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B13
`Chr1:42826078`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B100,B133,C7
`Chr1:42826078`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B100,B133,C7
`Chr1:42827622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:42827679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:42827704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:42827707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811637.1

227 aa

114

227

DUF7054

PF23156 DUF7054 105-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811637.1`	Pfam	`PF23156`	DUF7054	Domain	105	188	1.9e-30	105.3	Domain of unknown function (DUF7054)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955654.1
GTAATAAGAGAACAAAGGAAAAGAATAATATGTATGTTTGTATGTAAATGGAGTAGTAAAGATGCATCAACGAAGGAAACAGAATAAACCTCCCACCTCTCCACTCCTCCTTCCCTCGCTTCCTTTTCTTATACACTAACTACGATTCTCTCACTCTCCAACTCCAACCCCCTCTCTCTCTCCATGGCTGATGACCACAGAGATTTCCGAAGAAGGAAGTTTCCGGCCAACCGGAGAACCGCCAGACGATCGCCGGCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025867
ATGGCTGATGACCACAGAGATTTCCGAAGAAGGAAGTTTCCGGCCAACCGGAGAACCGCCAGACGATCGCCGGCGGAGGCTCGGCGTAGAATCAATCCGGAGGCGGGAAGAAGTCTGTCTCCGAGTCCATCGGAATACGCCAATTTTCTGAAGAGATACAAGTCGGAGCCATTTCTGCCCAACTCGGCCGGCAGAGAGGTGGCGGTGATCGTGGATGAGGAGGCGGAGGAAGAAATGCTTTATCGGCCGCATACATGTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811637.1
MADDHRDFRRRKFPANRRTARRSPAEARRRINPEAGRSLSPSPSEYANFLKRYKSEPFLPNSAGREVAVIVDEEAEEEMLYRPHTCTDIFLPPSGSLQVYKYNRDAKVVVNVTVEGSPGAVRTMVKLGADVAETIKLVIKKYNQEGRTPPLHEAAAANCELHHSFFSLHRLKKSDLIGDIGSRSFYLRKQSINNHEDEAAQISFLPKFINNLIRATQKLCKIFGCIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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