当前解析结果
SmilChr05G003009| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003009 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003009 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003009 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 37327218 - 37327565 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025871 |
|---|---|
| GeneID | 131025871 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025871 |
| 原始查询 | LOC131025871 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025871 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811640.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057811640.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057811640.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811640.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811640.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:37327221 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B125,C58 |
Chr5:37327221 |
G |
GT |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B125,C58 |
Chr5:37327222 |
A |
ATC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B125,C58 |
Chr5:37327222 |
A |
ATC |
2bp_insertion | CDS_variant | 2 | B125,C58 |
Chr5:37327239 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B4,B69,B82,C41,C55 |
Chr5:37327249 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,B4 |
Chr5:37327261 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B121,C4 |
Chr5:37327283 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,B35,B73,B97,C67 |
Chr5:37327293 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,A9,B12,B136,B64 |
Chr5:37327300 |
G |
GGA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 10 | B10,B107,B29,B42,B78,C35,C37,C66,C83,C9 |
Chr5:37327308 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B112,B31,B47,B83 |
Chr5:37327325 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B99,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。