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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003094`

染色体: Chr05 坐标: 39264198-39266267 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003094`
名称	SmilChr05G003094
描述	uncharacterized SmilChr05G003094
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	39264198 - 39266267 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025906`
GeneID	`131025906`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025906`
原始查询	`LOC131025906`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=37.7; qcov=0.1; evalue=2.27e-06; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=31.9; qcov=0.136; evalue=4.63e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025906

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811667.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811667.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811667.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057811667.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811667.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:39264206`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B94,C26
`Chr5:39264206`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B94,C26
`Chr5:39264250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B105,B67
`Chr5:39264250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B67
`Chr5:39264252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,B88
`Chr5:39264302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr5:39264311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C71
`Chr5:39264339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C49
`Chr5:39264348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B80,C71
`Chr5:39264351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,C2,D8
`Chr5:39264363`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B55
`Chr5:39264363`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955684.1
ATGCGGAAGCCTGTGAAGGCATGCCAGCTTTGTATGGCGACTTCATATGCAACCGATGAATGTCCACAACTTTTCGAAGATGAAGAGCTTAATGCTATTGGACAACAGCCAGGAGGAAACAACGGAGGGCAAAACCAGAAACCTTTTGAGCCCTACAGACAGCAGTACAACAATCAAGGATGGAGGCAACATGAGAACCTTAGGTATGGCAACAACAACTTTTTGGGGCCAAACCAAGGGCAGACGAGTAACCCACCACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025906
ATGCGGAAGCCTGTGAAGGCATGCCAGCTTTGTATGGCGACTTCATATGCAACCGATGAATGTCCACAACTTTTCGAAGATGAAGAGCTTAATGCTATTGGACAACAGCCAGGAGGAAACAACGGAGGGCAAAACCAGAAACCTTTTGAGCCCTACAGACAGCAGTACAACAATCAAGGATGGAGGCAACATGAGAACCTTAGGTATGGCAACAACAACTTTTTGGGGCCAAACCAAGGGCAGACGAGTAACCCACCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811667.1
MRKPVKACQLCMATSYATDECPQLFEDEELNAIGQQPGGNNGGQNQKPFEPYRQQYNNQGWRQHENLRYGNNNFLGPNQGQTSNPPQYSQQPQQARGSSLSELVHQMAQQQVKFQQETEKFIMETRGGMQNVNSQLSHLAQADARLESKQGALPSQVEVKKVNAMTLRGGKELPEVAKEKNQEKLEINEQIEMGSADEEEFALEREAKRKTTGKGKEKSSQTEPLLPFPGRMAKEQEKEELTELVKIFKKVEVNMPLLVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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