当前解析结果
SmilChr05G003095| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003095 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003095 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003095 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 39340824 - 39341303 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025907 |
|---|---|
| GeneID | 131025907 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025907 |
| 原始查询 | LOC131025907 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025907 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811669.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057811669.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811669.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811669.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811669.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:39340830 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A6,B31,C83 |
Chr5:39340837 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B85,C33,C58,C85,D1 |
Chr5:39340849 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 23 | A1,A14,A24,B1,B122,B129,B132,B139,B2,B33,B46,B50,B59,B80,B98,B99,C25,C5,C64,C66,C77,C82,D3 |
Chr5:39340878 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
Chr5:39340895 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 43 | A11,A13,A16,A20,A21,A22,A4,A8,B10,B105,B113,B120,B130,B20,B27,B30,B37,B49,B5,B51,B54,B65,B66,B8,B80,B84,B9,C10,C13,C14,C35,C52,C57,C58,C60,C67,C68,C7,C70,C79,C83,C9,D1 |
Chr5:39340912 |
A |
AGG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 5 | B111,B37,B44,B7,C15 |
Chr5:39340912 |
A |
AGG |
2bp_insertion | CDS_variant | 5 | B111,B37,B44,B7,C15 |
Chr5:39340940 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B114,B25,B47,B88,D10 |
Chr5:39340942 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B83,B99,C26,C64,C66 |
Chr5:39340949 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B54,B86,D10 |
Chr5:39340950 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | B133,B134,B42,B64,B90,B97,C86,D7 |
Chr5:39340952 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。