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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003116`

染色体: Chr05 坐标: 39698658-39699681 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003116`
名称	SmilChr05G003116
描述	uncharacterized SmilChr05G003116
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	39698658 - 39699681 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025915`
GeneID	`131025915`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025915`
原始查询	`LOC131025915`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=37.5; qcov=0.252; evalue=1.36e-07; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025915

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811676.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811676.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811676.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811676.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:39698663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B75,D1
`Chr5:39698695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:39698698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B127,B59,C62
`Chr5:39698718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:39698733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:39698775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr5:39698776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B26
`Chr5:39698778`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A19,A8,B103,B112,B129,B22,B26,B50,B76,B80,B89,B94,C1,C27,C46,C61,C71,D8
`Chr5:39698814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr5:39698822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr5:39698858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A10,A11,A20,A25,B11,B117,B126,B138,B16,B23,B29,B33,B35,B44,B46,B6,B73,B75,B97,C24,C27,C3,C39,C41,C56,C67,C71,C75,C9,D10,D8
`Chr5:39698868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955693.1
ATGAAGATGTTTGAAACCCAAATGGGTCAAATGACCACTGCCATCAACAAGCTTCAGCAGTCGGGTAAATTCTTAAACAACGCTAAGGTGAACCCGAATGAGCAGTGCATGGTAATTGGGGTGAGAAGTGCAGCCACATCTGAAGGCAGCCATGGATCTTGTGAGATGGGAGATGAGTCAAAACAACACCATGAGAAAAGTCGACGAGTTCCACCCCTATATCGTCCTCCCGGTTGGATGCCATTTTCCCAACGTCATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025915
ATGAAGATGTTTGAAACCCAAATGGGTCAAATGACCACTGCCATCAACAAGCTTCAGCAGTCGGGTAAATTCTTAAACAACGCTAAGGTGAACCCGAATGAGCAGTGCATGGTAATTGGGGTGAGAAGTGCAGCCACATCTGAAGGCAGCCATGGATCTTGTGAGATGGGAGATGAGTCAAAACAACACCATGAGAAAAGTCGACGAGTTCCACCCCTATATCGTCCTCCCGGTTGGATGCCATTTTCCCAACGTCATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811676.1
MKMFETQMGQMTTAINKLQQSGKFLNNAKVNPNEQCMVIGVRSAATSEGSHGSCEMGDESKQHHEKSRRVPPLYRPPGWMPFSQRHYKIINSLSGTTQEGPKMVKDESAPPVMEKEAEEVTIEVSGTKKDEKKKATSPANEMPQYAKFLKDLVSRKKKLGTGRKLPAKIKDLGSFNISCIIGGQHFEKALCDLGVSINLMPLSIFKRLSIGEMKPTSMVLQMADRSVTHPLGVVENMLVKVGDFIFPADFMVLDIEDDKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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