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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003263`

染色体: Chr05 坐标: 42214271-42218705 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003263`
名称	SmilChr05G003263
描述	uncharacterized SmilChr05G003263
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	42214271 - 42218705 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025950`
GeneID	`131025950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025950`
原始查询	`LOC131025950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG00860` - identity=37.9; qcov=0.093; evalue=7.64e-20; confidence=weak
Rice	`Os08g0202300` - identity=35.2; qcov=0.325; evalue=5.76e-78; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13650 (Asp_protease_2); PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811711.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811711.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057811711.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057811711.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057811711.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:42215390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr5:42215969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:42215993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr5:42216017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C22
`Chr5:42216098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr5:42216124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr5:42216127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B35
`Chr5:42216129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C22,C27,C63,C79
`Chr5:42216135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B102,B89
`Chr5:42216181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C36,C66
`Chr5:42216251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr5:42216254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811711.1

1417 aa

708

1417

Asp_protease_2

RVT_1

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

PF13650 Asp_protease_2 607-699 aa PF00078 RVT_1 957-1119 aa PF17919 RT_RNaseH_2 1183-1281 aa PF17917 RT_RNaseH 1211-1311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811711.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	607	699	5.2e-07	31.0	Aspartyl protease
`XP_057811711.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	957	1119	7.3e-30	105.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057811711.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	1183	1281	2.4e-32	111.6	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057811711.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	1211	1311	5.2e-37	126.9	RNase H-like domain found in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955728.1
AAACGACGCACCAAATTTTGGCGCCGTTGCCGGGGATTGGTTTTAAGCAGGATTTTACTGATTTCAGTCTGTCTTTTATTTTTAGTTATTTTATTTTTAGTTTATGCCACGTTCTTCTCGTACAGGCGTATTAGTTTTTGATGCAGAAATCGAGAAGACTGCACGAAAGTTGAAGAAGCAAGCTAAGGAGTGGAAAAAGAGATCCAATTCTGCTCCACCGAGTCTTGAGGATCAAGAAGAAATTGAAGATCCAATGGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025950
ATGCCACGTTCTTCTCGTACAGGCGTATTAGTTTTTGATGCAGAAATCGAGAAGACTGCACGAAAGTTGAAGAAGCAAGCTAAGGAGTGGAAAAAGAGATCCAATTCTGCTCCACCGAGTCTTGAGGATCAAGAAGAAATTGAAGATCCAATGGGTGACCGTAATAATAGGGATGAGGAGAACGATAGAGAGATCGTTGATCCTCGACAGGAACCACCTCAACTGATCAGAGAGTTAGGCCGTCATAGAAGCAATCGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811711.1
MPRSSRTGVLVFDAEIEKTARKLKKQAKEWKKRSNSAPPSLEDQEEIEDPMGDRNNRDEENDREIVDPRQEPPQLIRELGRHRSNRPLCIVLPAINGNAEIRPGFIQVLPKFGDLPGESAHKHLAEFDLVCSTLRPHGFTENNLRLLTFSHTLQGRARDWLFDLPPGSIRTWGDLEEQFLRKFFPESRAANLRMAISSIKQKKAESLADYWERFQQLCRKCPDHGFSDYQLLTNYFYRGMSSFDRKIVDAACGGSLTNKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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