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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003287`

染色体: Chr05 坐标: 42975283-42977055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003287`
名称	SmilChr05G003287
描述	uncharacterized SmilChr05G003287
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	42975283 - 42977055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025958`
GeneID	`131025958`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025958`
原始查询	`LOC131025958`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025958

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811720.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057811720.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811720.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057811720.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057811720.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:42975285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr5:42975286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B126,C12,C47
`Chr5:42975286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C12,C47
`Chr5:42975297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B85,C4,C64,C66
`Chr5:42975305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C72
`Chr5:42975306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B61,C29,C5,C71
`Chr5:42975309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B87,C82
`Chr5:42975315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,C23,C55,D8
`Chr5:42975359`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B11,B115,B138,B72,C16,C34,C41,C48,C51,C52
`Chr5:42975372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B2
`Chr5:42975373`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B35,B55,C19,C30,C50,C54,C64
`Chr5:42975382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811720.1

562 aa

281

562

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 255-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811720.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	255	345	4.3e-06	28.0	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955737.1
ATGCAGTCCTTCATGGAGATCAGCAAGCAAAACATGGAGATGACTAAGCAAAATTTTGAGTCTCAATCCGCCACAATAAAAAGACTTGAGACTACCGTGGGGCAATTGTCGGGCACTTTGAACCAAATTCAACAGCAGCAGCAGCCCGGGAAATTTCATGACCAACCCCTGCAAACTCACCAGGCTCAAGCTGTCACTGTTCTTCGCAGCGGCAAAATGGTGGACAACAACGTGAAGGATCCGGAGCAGACCAGAAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025958
ATGCAGTCCTTCATGGAGATCAGCAAGCAAAACATGGAGATGACTAAGCAAAATTTTGAGTCTCAATCCGCCACAATAAAAAGACTTGAGACTACCGTGGGGCAATTGTCGGGCACTTTGAACCAAATTCAACAGCAGCAGCAGCCCGGGAAATTTCATGACCAACCCCTGCAAACTCACCAGGCTCAAGCTGTCACTGTTCTTCGCAGCGGCAAAATGGTGGACAACAACGTGAAGGATCCGGAGCAGACCAGAAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811720.1
MQSFMEISKQNMEMTKQNFESQSATIKRLETTVGQLSGTLNQIQQQQQPGKFHDQPLQTHQAQAVTVLRSGKMVDNNVKDPEQTRNSELPKSPLEKPALPIPEMPKSPLAKLALPSPEMPKSPLAKSALQNSAAQGSVLPSSTLTSPYEEEGPEQKKKEGEKEDQPKDRVMEEGKEAKLHKSTTPYRPPIPFPGRLRNEKMDKQFADFYNMFAKRKFEDNEKVLVSEIANSIIQQPLPPKQRDPSSFVIKIALGNGKEAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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