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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002510`

染色体: Chr01 坐标: 42996383-43000308 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002510`
名称	SmilChr01G002510
描述	uncharacterized SmilChr01G002510
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	42996383 - 43000308 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025964`
GeneID	`131025964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025964`
原始查询	`LOC131025964`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0568400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os07g0568400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G36720` (HVA22K) HVA22-like protein K [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829825] identity=61.3; qcov=0.443; evalue=1.9e-19; confidence=low
Rice	`Os07g0568400` - identity=58.1; qcov=0.443; evalue=5.98e-20; confidence=low
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811729.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057811737.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811737.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811729.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811729.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:42996821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C52
`Chr1:42997626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:42997633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:42997658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B22,C10,C46,C67
`Chr1:42997684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:42998372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:42998385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr1:42998496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B118,B124,B140,C10
`Chr1:42998499`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B55,B68,C31
`Chr1:42998499`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B55,B68,C31
`Chr1:42998508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A1,B113,B46,B55,B82,C17,C23,C34,C36,C52,C83,C87
`Chr1:42998528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811729.1

200 aa

100

200

PCC

PF03479 PCC 80-131 aa

XP_057811733.1

167 aa

167

PCC

PF03479 PCC 41-98 aa

XP_057811737.1

140 aa

140

PCC

PF03479 PCC 80-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811729.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	80	131	1.6e-07	32.1	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain
`XP_057811733.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	41	98	9e-13	49.0	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain
`XP_057811737.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	80	128	4.9e-07	30.5	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

12 records

下载 cDNA FASTA

XR_009102193.1
CCCGTAAGCCCTAAAATCCTAAATCCCAAAAACACCATCTTCAGCCGCCCCACAAATTCTCCCTCTGGCCTCCATGGCAACGACGAGAACCCCGCCGCGACTCGCCACCTGCCCCCGCCGCGTCCTTGCTTCCTCTGCCACCCACCGCGGCCCGCCACTCCTCTTTTGTGATAAAGCCCTAAATCAAAACTTAATTCAAATTCGAGTTCAATCAAACTCGTCACTCCCCGTCGCTGCTCTGTTCTGTGGCTCTCGAAGTC...

XR_009102194.1
CCCGTAAGCCCTAAAATCCTAAATCCCAAAAACACCATCTTCAGCCGCCCCACAAATTCTCCCTCTGGCCTCCATGGCAACGACGAGAACCCCGCCGCGACTCGCCACCTGCCCCCGCCGCGTCCTTGCTTCCTCTGCCACCCACCGCGGCCCGCCACTCCTCTTTTGTGATAAAGCCCTAAATCAAAACTTAATTCAAATTCGAGTTCAATCAAACTCGTCACTCCCCGTCGCTGCTCTGTTCTGTGGCTCTCGAAGTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131025964
ATGCCCAGTCCCGTCGTTTCCTGCACCACTTCGGAGCTCCGATGCTCAGCCCTTTCTCGTATCCCCGCCTCCGACGCGGGTAGCCTTCAGGTCAGGCTGCGGTTACTTCTTTGTCCATTTGGTTCCAATATTGTAGTTCGTACAGCATGCTGTTCGGTGGGGGTTGTCTTACCTGTTTATTCTACATTCAAGGCCATTGAGACGAAGGATCAAGATGACCAACACAAATGGCTTGTATGCTGGGCTGGTTCATTCCTTCT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057811729.1
MPSPVVSCTTSELRCSALSRIPASDAGSLQVRLRLLLCPFGSNIVVRTACCSVGVVLPVYSTFKAIETKDQDDQHKWLVCWAGSFLLSESIGNCSRTGGLSISLAGSDGRVLGGGVFGMLKAASPVQVHISPSLYLTVTPNFVMEKYKMANALSDLGTKIWLLSGDDINMSIRNRDMLILSSMNNTNDLGALNWNQILKR

XP_057811733.1
MQVRLRLLLCPFGSNIVVRTAWPLRRRIKMTNTNGLYAGLGRFEIISLSGSFLLSESIGNCSRTGGLSISLAGSDGRVLGGGVFGMLKAASPVQVHISPSLYLTVTPNFVMEKYKMANALSDLGTKIWLLSGDDINMSIRNRDMLILSSMNNTNDLGALNWNQILKR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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