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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003322`

染色体: Chr05 坐标: 43521927-43522733 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003322`
名称	SmilChr05G003322
描述	uncharacterized SmilChr05G003322
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43521927 - 43522733 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025965`
GeneID	`131025965`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025965`
原始查询	`LOC131025965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF08284 (RVP_2); PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025965

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811727.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811727.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057811727.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811727.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057811727.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43521967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:43521996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr5:43522016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:43522058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr5:43522062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr5:43522119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B75
`Chr5:43522228`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B75
`Chr5:43522247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C26
`Chr5:43522275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:43522277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B132,C9
`Chr5:43522277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C9
`Chr5:43522292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811727.1

268 aa

134

268

zf-CCHC

RVP_2

Asp_protease_2

PF00098 zf-CCHC 129-144 aa PF08284 RVP_2 168-260 aa PF13650 Asp_protease_2 191-257 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811727.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	129	144	8.5e-05	23.2	Zinc knuckle
`XP_057811727.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	168	260	1.1e-15	58.4	Retroviral aspartyl protease
`XP_057811727.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	191	257	9.8e-07	30.1	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955744.1
ATGTTAGTGGACACTGATGAGAAGCGCGCAGAGAAATTCAGGAACGGACTGCGCCACGAGATATCGATCTCCCTAGCGAGTCAGGGAGGTCTCACTTATGCACAAACACTGAGCAGGGCTCTCACCATTGAGTCATTGCTACCAAGGGAGAAAGCAAAAGCTCCGGGACAGTCTGGATTTGTACCACCTCAAGATGGTGGTAAAGGAAAAAGAAAGTGGAACGAGGGAGCTGGTGGAAACCCTGGAAATGGAAATGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025965
ATGTTAGTGGACACTGATGAGAAGCGCGCAGAGAAATTCAGGAACGGACTGCGCCACGAGATATCGATCTCCCTAGCGAGTCAGGGAGGTCTCACTTATGCACAAACACTGAGCAGGGCTCTCACCATTGAGTCATTGCTACCAAGGGAGAAAGCAAAAGCTCCGGGACAGTCTGGATTTGTACCACCTCAAGATGGTGGTAAAGGAAAAAGAAAGTGGAACGAGGGAGCTGGTGGAAACCCTGGAAATGGAAATGGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811727.1
MLVDTDEKRAEKFRNGLRHEISISLASQGGLTYAQTLSRALTIESLLPREKAKAPGQSGFVPPQDGGKGKRKWNEGAGGNPGNGNGKKPWVANQNQNQPQNQQHQAIIKTPCPKCQKLHMGECLRGMNICFTCGETGHYAPACPRKRGGAPQQPQNQGCGGHRGPPQNARAYALNQNQAAGNQENLVGMINVFDVPIIALFDTGASHSFISHAACKRLELTAQLAETTLEVSTPSGGRLAAKDVISNLELNIGAETFKAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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