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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003334`

染色体: Chr05 坐标: 43760913-43762337 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003334`
名称	SmilChr05G003334
描述	uncharacterized SmilChr05G003334
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	43760913 - 43762337 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025968`
GeneID	`131025968`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025968`
原始查询	`LOC131025968`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=28.2; qcov=1.09; evalue=1.52e-40; confidence=low
Rice	`Os01g0930300` - identity=26.7; qcov=0.639; evalue=2.88e-17; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025968

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811731.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811731.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811731.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811731.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811731.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:43760980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C82
`Chr5:43761021`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B28,C41
`Chr5:43761028`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	143	A11,A18,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,B101,B104,B107,B110,B114,B118,B12,B120,B121,B122,B125,B126,B128,B130,B131,B133,B134,B135,B137,B138,B14,B15,B19,B2,B20,B23,B24,B25,B26,B28,B30,B31,B32,B33,B38,B39,B41,B42,B43,B45,B47,B48,B49,B51,B52,B53,B55,B56,B59,B60,B63,B65,B67,B7,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B98,C1,C10,C11,C14,C15,C18,C20,C23,C24,C25,C26,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C37,C4,C43,C44,C45,C47,C5,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C65,C69,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C8,C80,C82,C84,D1,D10,D11,D6,D7
`Chr5:43761033`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A11,A2,A23,A3,B110,B125,B133,B137,B24,B30,B31,B32,B42,B43,B79,C20,C31,C58,C60,C62,C72,C82
`Chr5:43761117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	141	A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A20,A21,A3,A4,A7,B1,B10,B102,B105,B109,B110,B111,B114,B118,B12,B120,B122,B123,B125,B127,B129,B13,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B15,B16,B18,B2,B20,B21,B22,B25,B28,B29,B3,B33,B38,B39,B4,B40,B44,B45,B47,B49,B50,B51,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B62,B64,B69,B70,B71,B73,B74,B77,B81,B83,B84,B85,B87,B88,B89,B9,B93,B94,B96,B97,B99,C10,C11,C14,C15,C16,C17,C18,C23,C25,C26,C27,C29,C3,C30,C32,C33,C36,C41,C42,C44,C45,C46,C49,C5,C52,C53,C54,C56,C58,C62,C63,C65,C68,C69,C7,C72,C73,C74,C76,C77,C79,C8,C81,C84,C86,C87,C9,D10,D2,D3,D6,D7,D8,D9
`Chr5:43761151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B75,C75
`Chr5:43761166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C82
`Chr5:43761247`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B31,C82
`Chr5:43761247`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B31,C82
`Chr5:43761294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A11,A2,A23,A3,B110,B125,B133,B137,B30,B31,B32,B42,B43,B79,C20,C31,C58,C60,C62,C72,C82
`Chr5:43761305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C82
`Chr5:43761318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B28,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811731.1

474 aa

237

474

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 175-242 aa PF13456 RVT_3 341-454 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811731.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	175	242	1.2e-14	55.4	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057811731.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	341	454	4.2e-15	56.5	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955748.1
ATGCTTGCTAAACAAGAATGGAGGCTGCTTACTAATGATACATCTCTTCTTGCTCGTTCTCTTAAGGCCCGATATTTCCCTCGTAACGATTTGCTTCTTGCTAGAAATGCTCATAACCCATCTTTTGCATGGAAAAGTATTCTAGTGGGCAGAGATTTACTTGGGGCTGGTTTGGCATGGAAATTGGGCAACAGAGATCGTATACGAATTGGTTTAGATCCTTGGCTACCTAATGGGAGAGGGCAGTTTGAACGTGCTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025968
ATGCTTGCTAAACAAGAATGGAGGCTGCTTACTAATGATACATCTCTTCTTGCTCGTTCTCTTAAGGCCCGATATTTCCCTCGTAACGATTTGCTTCTTGCTAGAAATGCTCATAACCCATCTTTTGCATGGAAAAGTATTCTAGTGGGCAGAGATTTACTTGGGGCTGGTTTGGCATGGAAATTGGGCAACAGAGATCGTATACGAATTGGTTTAGATCCTTGGCTACCTAATGGGAGAGGGCAGTTTGAACGTGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811731.1
MLAKQEWRLLTNDTSLLARSLKARYFPRNDLLLARNAHNPSFAWKSILVGRDLLGAGLAWKLGNRDRIRIGLDPWLPNGRGQFERANVLGDGAGLRARDLMNEADYTWDLRKLEEVLDHRDRWKILVQMKGRPYELDKPFWPSGKLNEYSIRSGHHLAMELRMRNEASSSSPFRILWSWIWNLDVIPKVRHFMWKCLAGALPSAMGLRSRGVDIDLVCRRCGEHEEKVEHALRDCKWIEMLWAVSPIRLSPMQTVCSIPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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