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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003346`

染色体: Chr05 坐标: 44010707-44011847 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003346`
名称	SmilChr05G003346
描述	uncharacterized SmilChr05G003346
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44010707 - 44011847 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025973`
GeneID	`131025973`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025973`
原始查询	`LOC131025973`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=20.6; qcov=0.789; evalue=4.45e-12; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=32.5; qcov=0.798; evalue=1.53e-38; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025973

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057811736.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811736.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811736.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811736.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811736.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44010748`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A14,A15,A7,B105,B109,B114,B123,B127,B132,B9,C30,C49,D6
`Chr5:44010761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:44010770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B133,B57,C32,C56
`Chr5:44010781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	87	A1,A14,A15,A2,A20,A21,A3,A7,A9,B1,B101,B102,B104,B105,B109,B112,B115,B117,B119,B12,B121,B122,B123,B127,B132,B135,B136,B139,B140,B19,B2,B22,B23,B26,B27,B32,B33,B36,B37,B40,B54,B61,B64,B66,B68,B69,B70,B72,B76,B77,B78,B8,B82,B87,B89,B9,B93,B99,C11,C16,C22,C23,C26,C30,C36,C38,C4,C40,C42,C46,C48,C49,C50,C64,C66,C69,C73,C75,C77,C78,C87,D11,D3,D5,D6,D8,D9
`Chr5:44010804`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B56
`Chr5:44010804`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B56
`Chr5:44010820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B133,C32
`Chr5:44010928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B66,C32,C38
`Chr5:44010970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B61
`Chr5:44011055`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A20,A4,A8,B114,B118,B12,B126,B19,B25,B53,B63,B67,B73,C15,C33,C34,C54,C57,C70,C73,C78,C84
`Chr5:44011089`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	49	A10,A11,A15,A16,A19,A6,A8,B10,B117,B118,B136,B138,B23,B34,B39,B48,B53,B60,B7,B73,B8,B80,B83,B85,B9,B94,B97,C13,C20,C21,C28,C3,C34,C35,C38,C40,C42,C43,C49,C58,C59,C72,C78,C79,C8,C81,C83,C84,D6
`Chr5:44011169`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811736.1

351 aa

176

351

SWIM

PF04434 SWIM 182-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811736.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	182	202	4.7e-05	23.5	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955753.1
ATGGTATACATTCACTTGCACCAAATAGTGAGCATAGGCATTGTGCTCGGCACATATATGCCAACTGGAAGAAAAACTTTGCAGGTCCGAAGTACAAGGCACTTTTTTTGGAATGTTGTGAAGGCAACGTGCAAGACGGACTATGAGTGGGCGCTTGGTGAATTGAAGAAAACAAGCACAGAGGCTACCGATGACTTTGAGGGTAGAGGGACGAATGCTTTTTGCAAGGCTTTGGTTAATAGCTTCACAAAGACTGACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025973
ATGGTATACATTCACTTGCACCAAATAGTGAGCATAGGCATTGTGCTCGGCACATATATGCCAACTGGAAGAAAAACTTTGCAGGTCCGAAGTACAAGGCACTTTTTTTGGAATGTTGTGAAGGCAACGTGCAAGACGGACTATGAGTGGGCGCTTGGTGAATTGAAGAAAACAAGCACAGAGGCTACCGATGACTTTGAGGGTAGAGGGACGAATGCTTTTTGCAAGGCTTTGGTTAATAGCTTCACAAAGACTGACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811736.1
MVYIHLHQIVSIGIVLGTYMPTGRKTLQVRSTRHFFWNVVKATCKTDYEWALGELKKTSTEATDDFEGRGTNAFCKALVNSFTKTDVVDNSVSETFNSYILKCRDKVLIGMLEDIRTMIMTRIYDLSSSMEKLLHSSDPLCPNVRKKSNKLQGKIRLCDVRPAVGGKFEVHMYDDTHVVCLIDRECTCRAWELTGIPCCHALSCIFHNRDDPVKFIDHFYYKNNTIECYKHGLSPLRGFKSWPKVDEVPIFPTKYSRSAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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