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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003362`

染色体: Chr05 坐标: 44424122-44426810 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003362`
名称	SmilChr05G003362
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	44424122 - 44426810 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025980`
GeneID	`131025980`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025980`
原始查询	`LOC131025980`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=29.4; qcov=0.912; evalue=5.77e-81; confidence=low
Rice	`Os02g0202800` (OJ1135_F06.10-2) - identity=28; qcov=0.894; evalue=2.46e-68; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025980

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811744.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811744.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811744.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811744.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811744.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:44424149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:44424167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B131,B22,B36,D5
`Chr5:44424277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B7
`Chr5:44424328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B6,B99,C31,D2
`Chr5:44424393`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C57
`Chr5:44424393`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C57
`Chr5:44424483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B95,C26,C6,C83
`Chr5:44424562`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A10,D4
`Chr5:44424562`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A10,D4
`Chr5:44424582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B16,C46
`Chr5:44424710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr5:44424763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811744.1

635 aa

318

635

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 41-136 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 229-336 aa PF10551 MULE 257-347 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811744.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	41	136	5.9e-12	46.9	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057811744.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	229	336	4.8e-08	33.7	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057811744.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	257	347	2.4e-25	89.5	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955761.1
ATGGAATTATCAGATAATTTCAATCCAAGTATTCCAGATCGTCAAATATGCTTCCCTACTTCTGCCAATACATTAAAACCATATGTTGGACAGCTGCATAATACACTCGATGAAGGTGTTAAGTTTTATAAAGCATATGCTGCCGCATGTGGTTTCCAGTGTCGGATGAGTACTATTATATATGCTGCAGATGGCACTATTCGACTCAGATATGTTTTATGCAATAGAGAAGGAGTGTGGGACAAGGTCGATGGGACACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025980
ATGGAATTATCAGATAATTTCAATCCAAGTATTCCAGATCGTCAAATATGCTTCCCTACTTCTGCCAATACATTAAAACCATATGTTGGACAGCTGCATAATACACTCGATGAAGGTGTTAAGTTTTATAAAGCATATGCTGCCGCATGTGGTTTCCAGTGTCGGATGAGTACTATTATATATGCTGCAGATGGCACTATTCGACTCAGATATGTTTTATGCAATAGAGAAGGAGTGTGGGACAAGGTCGATGGGACACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811744.1
MELSDNFNPSIPDRQICFPTSANTLKPYVGQLHNTLDEGVKFYKAYAAACGFQCRMSTIIYAADGTIRLRYVLCNREGVWDKVDGTLNEHGNPLKKKRKTTSSRCDCMARAIFEVVDGGRYKIRRFNEGHTHSMVPAHTRHLMTGNRKVGELEQLFIISGVKANIGAMRTFRLYRELIGSYEAVGCTSDDFKNYVRDLKGHSLDSDAKMLLDALTNKQELGDGFKFICDVDEEKKMRRLIWTDETAVKNYKIYGEAVSFD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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