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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003396`

染色体: Chr05 坐标: 45011074-45012231 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003396`
名称	SmilChr05G003396
描述	uncharacterized SmilChr05G003396
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45011074 - 45012231 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025990`
GeneID	`131025990`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025990`
原始查询	`LOC131025990`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=38.5; qcov=0.815; evalue=9.27e-45; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=38; qcov=1.16; evalue=4.28e-71; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025990

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811754.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057811754.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811754.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811754.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45011084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,D4
`Chr5:45011108`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	39	A20,A23,B10,B102,B104,B11,B118,B120,B129,B136,B22,B27,B3,B38,B4,B49,B52,B6,B67,B82,B85,B94,B95,C12,C15,C26,C29,C31,C35,C46,C5,C58,C63,C78,C81,C9,D10,D4,D9
`Chr5:45011110`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C26
`Chr5:45011110`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C26
`Chr5:45011170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	121	A10,A13,A16,A19,A23,A3,A4,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B11,B110,B118,B120,B123,B125,B126,B127,B129,B131,B133,B136,B140,B16,B18,B20,B22,B25,B26,B27,B29,B3,B32,B34,B36,B38,B39,B4,B41,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B55,B58,B6,B60,B61,B63,B65,B67,B69,B70,B71,B77,B78,B79,B8,B82,B83,B85,B9,B91,B93,B94,B95,B97,C10,C11,C14,C17,C18,C19,C27,C28,C29,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C41,C44,C45,C46,C48,C5,C51,C54,C57,C58,C6,C61,C63,C7,C74,C76,C78,C81,C83,D1,D10,D11,D2,D4,D6,D7,D9
`Chr5:45011199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B96,C11,C69
`Chr5:45011202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B9,B94
`Chr5:45011203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:45011215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B10,C76,D6
`Chr5:45011215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,C76,D6
`Chr5:45011233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A19,A21,A7,A9,B10,B108,B11,B115,B118,B125,B131,B135,B138,B15,B27,B29,B3,B32,B36,B43,B47,B60,B65,B69,B74,B75,B76,B77,B78,B83,B95,C2,C26,C35,C45,C5,C50,C51,C57,C62,C72,C75,D10,D11,D6,D7
`Chr5:45011250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811754.1

319 aa

160

319

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 28-66 aa PF04827 Plant_tran 111-270 aa PF13359 DDE_Tnp_4 126-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811754.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	28	66	9.2e-18	64.4	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057811754.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	111	270	1.7e-62	211.4	Plant transposon protein
`XP_057811754.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	126	262	4e-08	33.7	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955771.1
ATGAGCTCCAGGAGCATAAACAGTTGCTTGCTTCGTGTTATTCATCACCGTCAATACGTCCACCGTGATCGTGAGGGTGCCCATTTACGTCTTATGCAAGACTACTTCAACGACAATCCGACGTACAGGCCTATATTTTTTCGACGTTGTTTTCAGATGCAGAAGGAGTTGTTCTTGCGCATCGTTGAGGCTGTTCAATGTGAAGATATTTACTTCCAGATGAGCCATGATGCACGAGGTCAAGACTCTCTCACACCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025990
ATGAGCTCCAGGAGCATAAACAGTTGCTTGCTTCGTGTTATTCATCACCGTCAATACGTCCACCGTGATCGTGAGGGTGCCCATTTACGTCTTATGCAAGACTACTTCAACGACAATCCGACGTACAGGCCTATATTTTTTCGACGTTGTTTTCAGATGCAGAAGGAGTTGTTCTTGCGCATCGTTGAGGCTGTTCAATGTGAAGATATTTACTTCCAGATGAGCCATGATGCACGAGGTCAAGACTCTCTCACACCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811754.1
MSSRSINSCLLRVIHHRQYVHRDREGAHLRLMQDYFNDNPTYRPIFFRRCFQMQKELFLRIVEAVQCEDIYFQMSHDARGQDSLTPLQKYTAVIRQLVTGISADTFDEYLKAWHGAYTRSDQEEPTLILEVVASHDLWIWHAFFNVAGSNDINVLNQSPLFSDVLDGTAAPVLFEANRRYYQMDYYLCDGIYSKWRCFVKSPPMATNLKEARFKKMQESARNDAERAFGMLQARWGIIRSPARGWYIKNLKDMMMCCIIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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