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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003546`

染色体: Chr05 坐标: 47356931-47357446 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003546`
名称	SmilChr05G003546
描述	uncharacterized SmilChr05G003546
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	47356931 - 47357446 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026031`
GeneID	`131026031`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026031`
原始查询	`LOC131026031`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=37.9; qcov=0.819; evalue=8.22e-24; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026031

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057811791.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811791.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811791.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811791.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811791.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:47356944`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B135,B28
`Chr5:47356944`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B135,B28
`Chr5:47357066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A1,A14,A5,A9,B104,B106,B129,B137,B2,B43,B50,B6,B64,B65,B7,B82,B92,C18,C29,C4,C41,C42,C43,C71,C80,D8
`Chr5:47357067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B121,B42,B67
`Chr5:47357067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B42,B67
`Chr5:47357078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:47357127`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A21,C61,C68
`Chr5:47357127`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A21,C61,C68
`Chr5:47357147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr5:47357185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B121,D4
`Chr5:47357203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B7,B88,C13,C77
`Chr5:47357205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811791.1

171 aa

171

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 27-169 aa PF03732 PEG10_N-capsid 35-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811791.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	27	169	4.4e-09	36.7	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057811791.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	35	113	1.3e-13	51.8	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955808.1
ATGGCAACTAGAACCCGAGGTAGAAACAACGGAAACCGCGAGAATGAGGAACTAGTTAATCATATTCCAATTCGTGATACCGAAAATATGTTCAGGAAACAACACCCTCCAACTTTTGATGGCTTAGGTGATCCAGTAGACGCTGAAAAATGGGTTAGCACGATAGAAAGAATATTTACCTATATAAGGTGTGACGATAAAGAGAAGGTAATTTGTGCAAAATACCAAATGATTGATGAGGCTGACTTCTGGTGGGAGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026031
ATGGCAACTAGAACCCGAGGTAGAAACAACGGAAACCGCGAGAATGAGGAACTAGTTAATCATATTCCAATTCGTGATACCGAAAATATGTTCAGGAAACAACACCCTCCAACTTTTGATGGCTTAGGTGATCCAGTAGACGCTGAAAAATGGGTTAGCACGATAGAAAGAATATTTACCTATATAAGGTGTGACGATAAAGAGAAGGTAATTTGTGCAAAATACCAAATGATTGATGAGGCTGACTTCTGGTGGGAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811791.1
MATRTRGRNNGNRENEELVNHIPIRDTENMFRKQHPPTFDGLGDPVDAEKWVSTIERIFTYIRCDDKEKVICAKYQMIDEADFWWESVERTMTQAQKDTLTWEDFKEKLFEKFIPECYRQKRQNEFWNLRHGKNTVTEYDRQFNRLSRYYPQLVDTDEKKADKFKKGLHAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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