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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002517`

染色体: Chr01 坐标: 43118565-43122560 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002517`
名称	SmilChr01G002517
描述	probable sodium/metabolite cotransporter BASS5, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43118565 - 43122560 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026036`
GeneID	`131026036`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026036`
原始查询	`LOC131026036`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable sodium/metabolite cotransporter BASS5, chloroplastic
产物	probable sodium/metabolite cotransporter BASS5%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G22840` (AT4G22840) Sodium Bile acid symporter family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828383] identity=71.7; qcov=0.986; evalue=4.27e-140; confidence=high
Rice	`Os09g0520600` (BASS5) - identity=72.8; qcov=0.986; evalue=4.96e-142; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01758 (SBF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026036

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057811797.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057811797.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057811804.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057811804.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057811813.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43119548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C17
`Chr1:43119594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:43119686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:43119700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B4,B64,C36,C4
`Chr1:43119855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B122,D11,D3,D6
`Chr1:43119924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B4,B64,C36,C4
`Chr1:43120194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B131,B139,C20
`Chr1:43120763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B32,C78
`Chr1:43122197`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B122,D3,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811797.1

418 aa

209

418

SBF

PF01758 SBF 137-320 aa

XP_057811804.1

305 aa

152

305

SBF

PF01758 SBF 24-207 aa

XP_057811807.1

305 aa

152

305

SBF

PF01758 SBF 24-207 aa

XP_057811813.1

276 aa

138

276

SBF

PF01758 SBF 1-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811797.1`	Pfam	`PF01758`	SBF	Family	137	320	1.1e-43	149.9	Sodium Bile acid symporter family
`XP_057811804.1`	Pfam	`PF01758`	SBF	Family	24	207	2.7e-44	151.9	Sodium Bile acid symporter family
`XP_057811807.1`	Pfam	`PF01758`	SBF	Family	24	207	2.7e-44	151.9	Sodium Bile acid symporter family
`XP_057811813.1`	Pfam	`PF01758`	SBF	Family	1	178	7.2e-42	143.9	Sodium Bile acid symporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955814.1
CCTGGACAGCCTAAAATCAACAACTCACTTTTAGTTTGAAGTTCATTTCCCCACATTTGACTACGATACAGAATCATGATTATGGGTGTCAATGGCAATGGCAACCTTCTTCACTACTCTCACGCCTTCCACCGATGCCCCTCTCTTCTCCTCCATTCTCCCAATCGCTCCCCCACCGCTGTCGCTGCTTCTTCTCTGCAGAATTCCTCCCAATTTTCAAGATTGCGTTCGTCAAGCTTCCTTTCTCATTTAAGCTCGGG...

XM_057955824.1
GATTGCGTTCGTCAAGCTTCCTTTCTCATTTAAGCTCGGGTGGAATAAGTAGATCTTTAATCAGCAAGTATGCTCCAGATAATCTATCGCCGGAATTGCCTTTTGAGCACCAATCGGAATCGCCTAAGGTATTATGCTCCAGCATTAGGCTTTCTGATGTTTGCTGTCGGAGTTAATTCAAGCGAGAAAGATTTTCTTGAAGCATTTAGGAGACCAGCAGCCATTTCTGCTGGTTACATTGGACAGTTTGTCATCAAGCC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131026036
ATGATTATGGGTGTCAATGGCAATGGCAACCTTCTTCACTACTCTCACGCCTTCCACCGATGCCCCTCTCTTCTCCTCCATTCTCCCAATCGCTCCCCCACCGCTGTCGCTGCTTCTTCTCTGCAGAATTCCTCCCAATTTTCAAGATTGCGTTCGTCAAGCTTCCTTTCTCATTTAAGCTCGGGTGGAATAAGTAGATCTTTAATCAGCAAGTATGCTCCAGATAATCTATCGCCGGAATTGCCTTTTGAGCACCAATC...

LOC131026036
ATGCTCCAGATAATCTATCGCCGGAATTGCCTTTTGAGCACCAATCGGAATCGCCTAAGGTATTATGCTCCAGCATTAGGCTTTCTGATGTTTGCTGTCGGAGTTAATTCAAGCGAGAAAGATTTTCTTGAAGCATTTAGGAGACCAGCAGCCATTTCTGCTGGTTACATTGGACAGTTTGTCATCAAGCCCCTTTTTGGATATCTTTTTGGTACGATTTCAATGACGATCTTCGGTCTCCCAATGCCCCTGGCTGTTGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057811797.1
MIMGVNGNGNLLHYSHAFHRCPSLLLHSPNRSPTAVAASSLQNSSQFSRLRSSSFLSHLSSGGISRSLISKYAPDNLSPELPFEHQSESPKIQEKVSLLSILKGANSFLPQVVLASTILALVYPPSFTWFTNRYYAPALGFLMFAVGVNSSEKDFLEAFRRPAAISAGYIGQFVIKPLFGYLFGTISMTIFGLPMPLAVGIMLTSCVSGAQLSNYATFLTDPEMAPLSIVMTSLSTASAVFVTPFLSLLLIGTKLPVDVK...

XP_057811804.1
MLQIIYRRNCLLSTNRNRLRYYAPALGFLMFAVGVNSSEKDFLEAFRRPAAISAGYIGQFVIKPLFGYLFGTISMTIFGLPMPLAVGIMLTSCVSGAQLSNYATFLTDPEMAPLSIVMTSLSTASAVFVTPFLSLLLIGTKLPVDVKGMVSNILQIVVTPIATGLLLNRFFPRICTAIRPILPPLSVFVTALCVGAPLAINVKSVMSPSGISVLLLVIAFHLSAFLAGYWLTGLAFCDLPDVKALQRTLSYETGMQSSLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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